康成生物为您提供羟甲基化测序(hMeDIP-Seq)技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成技术服务人员就可为您完成全部实验操作,并提供完整的实验报告。
|
||||||||||||||||||
[发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] |
服务商: 上海康成生物工程有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
DNA羟甲基化测序(hMeDIP-Seq)服务
DNA羟甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对基因的表达起调控作用,在神经分化和癌症中发挥重要的作用。为深入了解5hmC的作用,我们就必须清楚5hmC在基因组的分布情况。然而,传统的基于重亚硫酸盐的方法无法区分5-hmC和5-mc。5-hmC单克隆抗体捕获法是研究DNA羟基化修饰的利器,结合高通量测序技术以及生物信息分析,可以获得全基因组羟甲基化分布图,从而能帮助我们从一个新的角度来解析胚胎发育,神经细胞分化以及癌症发生的分子机制。
康成生物为您提供羟甲基化测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括超声打断基因组、羟甲基化DNA免疫共沉淀、hMeDIP与 Input DNA文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。 |
DNA羟甲基化测序技术优势
* 特异性检测羟甲基化: 5-hmC抗体能够区分甲基化和羟甲基化信号,特异性的检测羟甲基化区域。
* 灵活度高:能够直接对任意物种的高羟甲基化片段进行测序,无需已知的基因组序列信息。
* 检测范围广:覆盖整个基因组范围的羟甲基化区域。
* 精确度高:能够在实际结合位点50个碱基范围内精确定位。
* 数字化信号:直接对羟甲基化片段进行测序和定量,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
康成生物提供的DNA羟甲基化测序服务流程
1. 羟甲基化DNA免疫共沉淀(hMeDIP)
2. 测序文库构建
3. DNA成簇(Cluster)扩增
4. 高通量测序
5. 数据分析
6. 提供实验报告
康成hMeDIP-seq技术服务优势
* hMeDIP富集效果特异性佳:hMeDIP是获得准确测序数据的关键。康成hMeDIP平台经过不断地优化,抗体富集效率高和特异性好。
* 严格的质控体系:康成生物在hMeDIP-seq每个关键步骤都加入了 质控实验(图2,3)。这些QC数据能够评估每个步骤的质量。如果达不到标准,我们会重复实验步骤或者优化实验体系,使得每个样品都能够顺利进入下个实验环节。
图2. hMeDIP-seq技术服务流程和关键步骤的质量控制
图3. hMeDIP-qPCR 质控。hMeDIP特异地富集羟甲基化的Spike-in序列,且阳性信号远高于背景噪音。
* 优化的文库制备流程: 起始量少至1μg乃至更少量的起始DNA样品即可进行羟甲基化测序实验;同时,对hMeDIP富集过程及测序文库严格的质量监控保证了高品质的测序结果。
* 对DNA羟甲基化水平进行数字化定量分析:通过对测序得到的大量序列进行深入分析,hMeDIP-seq得到的序列信息能够转换为可定量的羟甲基化水平信息。对基因组任意区域的羟甲基化水平给出定量的结果,并分析差异羟甲基化的区域。
* 可视化分析: 提供50bp精度的全基因组DNA羟甲基化信号可视化数据。通过UCSC基因组浏览器(UCSC genome browser),任意区域的羟甲基化水平能够直观的进行展示和比较。
上海康成生物工程有限公司
地址:上海市漕河泾高新技术开发区虹漕路421号63号楼2楼
免费热线:400-886-5058 ; 800-820-5058(座机)
电话:021-64451989 传真:021-64452021
网址:www.kangchen.com.cn