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菌种鉴定

菌种鉴定


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服务类别:测序/合成总访问:1691
最后更新:2014-4-19半年访问:15
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服务商: 南京科佰生物科技有限公司 查看该公司所有服务 >>
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菌种鉴定:
通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。科佰生物提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16srDNA鉴定和真菌26srDNA鉴定、真菌ITS鉴定,通过PCR扩增16SrDNA、26SrDNA或真菌ITS片段,测序后在GeneBank对比即可。

细菌16S rDNA部分序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,只使用Seqforward进行一个测序反应(有效序列500-600bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。

细菌16S rDNA全序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500bp左右,需进行三个测序反应,以得到较为全面的种属特异性信息。

真菌26S rDNA D1/D2区序列解析:PCR扩增真菌26S rDNA D1/D2区片段,长度在500-600bp左右,只需进行一个测序反应*,即可得到26S rDNA D1/D2区序列信息。该方法尤为适合对酵母菌进行鉴定。

真菌ITS区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2)?全序列解析:PCR扩增真菌ITS区片段,长度在300-1,000bp左右,依据PCR扩增片段的长度,进行一个或两个测序反应,即可得到ITS区全序列信息。

 

服务编号 服务项目 服务说明 服务价格 周期(工作日)
SM052 16srDNA部分序列鉴定 针对16S rRNA测序(500-600bp) 300元 8工作日
SM053 16srDNA全序列鉴定 针对16S rRNA全长测序(约1500bp) 500元 10工作日
SM054 真菌26srDNA鉴定 26S rDNA D1/D2区片段测序(500-600bp) 400元 10工作日
SM055 真菌ITS鉴定 ITS区片段(300-1000bp) 400元 10工作日

服务说明:

1.样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA。若您提供平板,甘油菌或穿刺菌,请注明培养条件,菌种培养需特殊培养基的请提供培养基;另外请您确保您提供的菌种的纯度,因菌种不纯造成的测序套峰,我们将收取全额的实验费用。

2.若您提供的样品为基因组DNA,请确保其浓度>20ng/ul,体积>20ul,且无明显降解。

3.鉴定结果一般可以鉴定到种。个别菌种由于微生物数据库相关数据缺乏,只能鉴定到属。如遇这种情况,正常收费。

4.细菌样品是否具有致病性和潜在危险,如您对样品具有一定的致病性或均有潜在的危险,请您提供基因组DNA,并对其进行处理以灭活致病菌。

5.如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。

6.对于鉴定的菌株,若需要公司对菌株进行保种服务,请详细说明,公司会收取一定的额外费用。

提交的产品和资料:

实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图.

订购方法:
1、询价及订购请填写"询价单",并发送邮件至sales@cobioer.com
2、根据客户信息,我们会上门取样品
3、如需帮助,请发送邮件至tech@cobioer.com或拨打025-86880024,科佰生物的技术支持将竭诚为您服务。
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