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microRNA(miRNA)测序服务

microRNA(miRNA)测序服务


microRNA(miRNA) Sequencing Service
康成生物以Illumina Genome Analyzer IIx为技术平台,提供microRNA测序服务。高通量测序技术具备数字化信号、任意物种的高通量分析、高灵敏度、高质量数据、高置信度等优势。
服务类别:测序/合成总访问:4238
最后更新:2018-11-26半年访问:20
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microRNA测序服务

     microRNA是一类大小为21-23nt的非编码小RNA分子,通过沉默或降解其靶点mRNA分子调控基因表达。大量研究表明,microRNA在正常发育过程以及疾病发生过程中具有重要的作用,在诊断和治疗领域具有光明的应用前景。然而目前研究microRNA的方法主要是通过实时定量PCR以及基因芯片技术,这些方法主要关注microRNA的表达与定量,并仅局限于研究那些序列信息或二级茎环结构信息已知的microRNA,无法寻找和发现新的microRNA分子。
     基于Illumina高通量测序平台的microRNA测序技术突破了目前研究技术手段上的局限性,不但可以检测microRNA表达差异,而且可以研究microRNA的3’异质性,众多的isomiR(microRNA异构体),以及未发现的新的microRNA,为更加灵活、深入研究microRNA提供解决方案。

 

康成生物为您提供microRNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、小RNA文库构建和纯化、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。

 

microRNA测序技术优势
* 适用于所有物种的microRNA表达谱分析——无需预知microRNA的序列和二级结构信息
全基因组范围的表达谱分析——涵盖了任意长度的,已知和未知的microRNA
数字化信号——测序直接获得序列,可鉴别序列间单个碱基的差异,识别microRNA变体;
检测范围宽——跨越5个数量级的宽检测阈值,从几个到数十万个拷贝精确计数;
灵敏度高——每个独立的测序通道可以检测多达1000万转录组分子序列,提供了极大的数据深度与覆盖率,能够检测丰度极低的,以及稀少的microRNA。
数据质量高——microRNA测序具有极大的测序通量,灵敏度与精确性,同时其产生的定量数据与实时定量PCR结果具有很高的一致性。
生物信息分析更丰富——能够随时使用最新的microRNA数据库注释原始数据中已知的microRNA,还能够进一步发掘未匹配数据,发现新的microRNA种类及异构体,寻找更深入的研究信息。

 

 

康成生物microRNA测序的特点

1. 一站式解决方案

康成生物独家为您提供microRNA高通量测序全程技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞样本,康成的测序技术服务人员就可为您完成全部实验操作,并提供完整的实验报告。

2.  适合样品量少的客户

康成对测序实验经过优化,从总RNA开始实验,不需要对MicroRNA进行富集和反复的纯化,因此对于样品量少的客户更加适合, 1ug就可以进行实验。

3.  节省实验的步骤,减少实验误差

传统方法是先对microRNA进行富集,再两边加接头,而且每一步都要纯化回收,很容易产生实验误差,而我们只需要对总RNA就能完成实验,减少实验误差。
4. 深入的数据分析

康成生物拥有强大的生物信息学团队,能够根据不同客户的要求进行标准和深入的数据分析,提供能直接用于文章发表的图表和数据。

 

康成生物提供的microRNA测序服务流程


1. 样品RNA准备
2. 测序文库构建

   PAGE胶纯化特定大小的microRNA分子
    连接5’RNA接头
    连接3’RNA接头
    逆转录反应获得cDNA测序文库
    高保真聚合酶扩增构建的测序文库
3. DNA成簇(Cluster)扩增
4. 高通量测序(Illumina Genome Analyzer IIx)
5. 数据分析

    原始数据读取
    使用公用microRNA数据库注释已知microRNA
    深层次数据分析
6. 提供实验报告
    原始数据报告(Fasta-Q格式),包含所有测序序列信息,碱基读取质量评估
    基本数据分析报告(Excel表格),包含有效序列的序列信息、与参考基因组比对后的注释信息等
    高级数据分析(应客户要求定制),如使用已知数据库注释已知microRNA及分析不同样本间表达水平差异,使用已知数据库鉴别rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA并预测新的microRNA,预测microRNA的靶点基因。

 

 

 

 

 

上海康成生物工程有限公司
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