Millipore试剂盒推荐使用Q800R3设备剪切染色质

染色质通常被认为是由DNA、组蛋白和非组蛋白组成的复合体。RNA染色质复合体的成分被认为是由mRNA或传统的snRNA组成，它在转录过程中短暂地与染色质相关联。然而，越来越多的证据表明各种类型的非编码RNA（例如：长链非编码RNA，增强子RNA，甚至miRNA）与染色质结合并可能通过序列特异性杂交和/或通过结构和空间机制来实现调节功能。为了更好地描述这些调控机制，需要一种方法来识别和描述RNA分子（包括编码和非编码）、蛋白质和DNA之间的相互作用。
 
Magna ChIRP^TM（点击下载说明书）是由Millipore（默克-密理博）推出的用于研究和lncRNA（长链非编码RNA）相互作用的染色质DNA序列及蛋白的商品化试剂盒。它的全称是Magna ChIRP^TM。这个试剂盒采用了独特的方法，可以发现染色质关联RNA（如lncRNA）与基因组DNA序列的结合位点，也可用于lncRNA调节复合体的蛋白质组分进行蛋白组学分析。
 
染色质或染色质RNA复合体的研究离不开超声波剪切仪。Millipore（默克-密理博）在ChIRP^TM使用手册里推荐用Qsonica的Q800R3染色质/DNA剪切超声波破碎仪来完成染色质的修剪。
 

Kit说明书内页截图：

 
Magna ChIRP^TM基本原理如下图：