PCR Efficiency在线分析工具在预测PCR扩增效率的使用

目前已开发多种工具可以进行PCR引物的设计，但大多数工具只考虑避免发夹结构形成、3'末端核苷酸的选择、引物解链温度等问题，并没有考虑内在扩增子的特征以及没有预测给定扩增子和引物对的PCR扩增效率。
 

Izaskun Mallona等人^[1]使用了一种基于90个引物对组合的统计方法，扩增来自细菌、酵母、植物和人类的模板，扩增子大小在74到907bp 之间，以确定影响PCR效率的参数。最终开发了一个拟合数据的广义加法模型，并构建了PCR Efficiency在线分析工具（http://130.60.24.89/efficiency.html），允许从给定序列开始获得针对PCR 优化的寡核苷酸，并可以预测出扩增效率。
 

有个这款小工具，还怕做不好PCR实验吗？现在快快试用我们的数字PCR系统和实时荧光定量PCR系统，你们就知道预测工具好不好用了。
 

naica^®微滴芯片数字PCR系统
 

naica^®微滴芯片数字PCR系统，以Sapphire芯片（全自动）或Opal（高通量）芯片为耗材，形成由25,000-30,000个微滴组成的单层二维阵列，该单层微滴阵列形成后直接进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三通道成像，从而对起始核酸浓度进行绝对定量。仅需2.5小时即可获取结果。

Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统
 

Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统来自于美国Azure Biosystems公司，配备高品质温度模块，采用光纤和CMOS的检测系统，高能LED的激发，提供高灵敏和可靠的数据。
 

参考文献：

[1] Izaskun M ,  Julia W ,  Egea-Cortines M . pcrEfficiency: a Web tool for PCR amplification efficiency prediction[J]. BMC Bioinformatics, 2011, 12(1):404.