LightBench（全自动核酸电泳分析回收系统）助力ccfDNA检测研究

循环游离DNA（circulating cell-free DNA，ccfDNA）是人及动植物体液中、在细胞外，处于游离状态的DNA 分子。作为一种非入侵性的疾病诊断标志物，ccfDNA的检测有望替代目前的侵入性方法，在早期实现疾病的诊断和监控。因此ccfDNA在在液体活检领域掀起一阵新风暴。

 

来源于肿瘤细胞的ccfDNA又称为循环肿瘤DNA（Circulating cell-free DNA，ctDNA）。ctDNA含量与肿瘤进展阶段密切相关，准确检测ctDNA含量对肿瘤诊断和治疗有十分重要的意义。然而相较于全部ccfDNA，血液里ctDNA的含量很少，表现为非常低的等位基因频率。因此，通过PCR和三代测序的方法检测超低浓度的ctDNA时，产生误差的概率大大增加。全世界的科研工作者就如何降低这类误差做出了许多探索。近日，美国科学家借助LightBench全自动核酸凝胶电泳成像分析回收系统，并将独特应用发表了文献《Automated size selection for short cell-free DNA fragments enriches for circulating tumor DNA and improves error correction during next generation sequencing》。研究指出，通过提取较短片段的ccfDNA可以提高ctDNA的基因频率，从而实现ctDNA的富集并且减少PCR和测序结果的误差。

 

LightBench能对每个泳道电压独立控制，可使得从25bp至基因组大小的目标片段同时到达回收孔，从而实现全自动富集回收。基于LightBench的这一功能，研究人员对黑色素瘤患者的ccfDNA富集回收分析，分离得到了较小片段的ccfDNA，并通过后续PCR及测序证实了此方法可以准确且可重复地分离目标片段大小ccfDNA。

 

  

接下来，研究人员对分离得到的较短片段的ccfDNA进行研究，对其中的目标ctDNA进行PCR扩增和测序，检测ctDNA含量。结果显示，较短片段的ccfDNA亚群中，ctDNA含量相对较高，实现了富集。

 

     

并且，研究人员对健康患者富集后的ctDNA和未经过富集的ctDNA进行了检测，并统计假阳性概率。结果显示较高的ctDNA含量可以减少结果的误差。

 

 

综上所述，基于LightBench全自动核酸凝胶电泳成像分析回收系统，研究人员分离得到了较短片段的ccfDNA，并实现了ctDNA的富集。从而降低肿瘤液体活检过程中出现假阳性结果的概率，提高了肿瘤筛查和诊断准确性，大大提高了将这些研究结果转化为临床应用的潜力。

 

关于LightBench全自动核酸电泳成像分析回收系统

LightBench全自动核酸电泳成像分析回收系统，是Coastal Genomics公司研发的集电泳图谱分析、片段选择回收、核酸浓度测定三大功能于一体的仪器。可以助您轻松完成枯燥繁琐的琼脂糖凝胶电泳实验！

LightBench采用专利的Ranger Technoogy进行全自动凝胶电泳，每次运行可同时分析96份样本，纯化回收12份样本，成像范围从25bp至基因组大小，DNA回收率80%以上。同时兼容汉密尔顿机器人液体处理装置，帮助用户提升工作效率，简化工作流程，快速实现高通量核酸分析及核酸片段回收。

普瑞麦迪（北京）实验室技术有限公司于2018年5月正式成为Coastal Genomics中国区独家总代，期待进一步推进中国市场核酸研究与检测领域的发展！同时诚邀全国各区合作伙伴与我们携手合作！

 

LightBench技术优势：

 

●  精确的片段长度分析：25bp-基因组大小

●  低成本的片段全自动纯化回收

●  高灵敏度检测：200pg-1000ng;

●  高效率：96 个DNA片段长度分析<30min

●  全自动样品追踪

● 灵活兼容液体处理装置及核酸定量试剂

 

LightBench可应用于以下应用领域

 

●  三代测序

●  CFDNA富集

●  液体活检

●  考古等稀有DNA富集

·基因合成

·基因克隆

·基因测序

·基因分型

·核酸定量分析

·限制性片段长度分析