 |
对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序
|
|||||||||||||||||
| [发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] | ||||||||||||||||||
| 服务商： 上海中科新生命生物科技有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
基于illumina 测序平台，微生物多样性测序（又称扩增子测序）是指对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序，突破传统微生物不可培养的缺点，获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。
技术优势
▶ 样本类型广泛：粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本
▶ 灵活：多种测序策略可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求
▶ 鉴定到“种”，准确性高：菌群多样性鉴定精细到“种”，分类更明确；从碱基保守水平测定，真实反映物种情况
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，数据质量高，Q30＞85%；
▶ 质控严格：严格的质控管理，确保每一个环节都出色完成
▶ 分析内容丰富：可选择与宏基因组、宏蛋白组、代谢组联合分析，分析内容更丰富。
参考文献
1.Gut bacterial diversity of the tribes of India and comparison with the worldwide data. Scientific Report. 2016, IF=5.228
16S rDNA扩增子测序，研究不同部落印度人肠道微生物的多样性
2.Combined Signature of the Fecal Microbiome and Metabolome in Patients with Gout. Frontiers in Microbiology. 2017，IF=4.076
16S rDNA扩增子测序+代谢组─挖掘痛风患者菌群-代谢相互之间的作用关系
3.Dysbiotic gut microbiota causes transmissible Crohn’s disease-like ileitis independent of failure in antimicrobial defence. Gut. 2016, IF=14.921
16S rDNA扩增子测序+宏蛋白组学，肠道微生物在慢性回肠炎疾病进展中的作用机制
4.The Dynamics of the Human Infant Gut Microbiome in Development and in Progression toward Type 1 Diabetes. Cell Host & Microbe. 2015，IF=12.552
16S rDNA扩增子测序+宏基因组+代谢组─研究婴儿肠道微生物在Ⅰ型糖尿病发病过程中的动态变化
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
▶ 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
▶ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
▶ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。
数据分析
生物领域各个研究方面，如：
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
▶ 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
▶ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
▶ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。
数据分析
| 分析内容 | 解决问题 |
| OUT聚类及物种注释 | 各样本的OUT聚类和注释结果 |
| 物种组成分析 | 各样本/分组在门、纲、目、科、属分类水平上的组成信息 |
| 进化分析 | 研究物种的系统进化关系 |
| 样品复杂度分析（Alpha多样性分析） | 分析各样品内微生物群落的多样性 |
| 样本比较分析（Beta多样性分析） | 分析各样本间的差异 |
| 组间群落结构差异分析 | 分析组间微生物群落结构的差异是否显著 |
| 组间物种差异分析 | 寻找组间具有显著差异的物种 |
技术优势
▶ 样本类型广泛：粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本
▶ 灵活：多种测序策略可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求
▶ 鉴定到“种”，准确性高：菌群多样性鉴定精细到“种”，分类更明确；从碱基保守水平测定，真实反映物种情况
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，数据质量高，Q30＞85%；
▶ 质控严格：严格的质控管理，确保每一个环节都出色完成
▶ 分析内容丰富：可选择与宏基因组、宏蛋白组、代谢组联合分析，分析内容更丰富。
参考文献
1.Gut bacterial diversity of the tribes of India and comparison with the worldwide data. Scientific Report. 2016, IF=5.228
16S rDNA扩增子测序，研究不同部落印度人肠道微生物的多样性
2.Combined Signature of the Fecal Microbiome and Metabolome in Patients with Gout. Frontiers in Microbiology. 2017，IF=4.076
16S rDNA扩增子测序+代谢组─挖掘痛风患者菌群-代谢相互之间的作用关系
3.Dysbiotic gut microbiota causes transmissible Crohn’s disease-like ileitis independent of failure in antimicrobial defence. Gut. 2016, IF=14.921
16S rDNA扩增子测序+宏蛋白组学，肠道微生物在慢性回肠炎疾病进展中的作用机制
4.The Dynamics of the Human Infant Gut Microbiome in Development and in Progression toward Type 1 Diabetes. Cell Host & Microbe. 2015，IF=12.552
16S rDNA扩增子测序+宏基因组+代谢组─研究婴儿肠道微生物在Ⅰ型糖尿病发病过程中的动态变化
手机版：微生物多样性测序
Copyright(C) 1998-2025 生物器材网 电话：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com