16S/18S/ITS等扩增子测序

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序是通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，通过高通量测序分析样品中的优势物种、稀有物种以及一些未知的物种，从而分析环境微生物多样性及群落组成差异。
 
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。16S rRNA序列包括10个保守区和9个高可变区，可以作为揭示生物物种的特征性核酸序列，被认为是最适于细菌系统发育和分类鉴定的指标。 18S rRNA在结构上分为保守区和高变区，保守区反映生物物种间的亲缘关系，高变区反映物种间的差异。
 
ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。ITS目前已被广泛用于真菌不同种属的系统发育分析。
 
分析内容

OUT分析及物种注释

单样品复杂度分析      ɑ-多样性分析      ɑ-多样性稀释曲线图

样品间复杂度比较分析 β-多样性分析 β-多样性热图

多元统计分析

 
3.宏基因组测序
宏基因组测序是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序，以分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。宏基因组测序研究避开了微生物分离培养的过程，扩展了微生物资源的利用空间，为微生物的研究提供了有效工具。
不依赖于微生物的
分离与培养，克服
技术优势
不依赖于微生物的分离与培养，克服了传统纯培养方法的技术限制，可认识和利用95%以上的未培养微生物可以得到环境中低丰度的微生物信息.研究环境中微生物菌群的多样性, 功能活性等，可更准确地反应出微生物生态的真实状态
 
 
分析内容

原始数据质量控制

宏基因组组装

物种种类和丰度分析

基因组组分分析

基因功能注释

样品多样性分析

 
 
4.宏转录组测序
宏转录组测序是以环境中全部RNA作为研究对象，从整体水平上研究某一特定环境，特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律。它以生态环境中的全部RNA为研究对象，避开了微生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。与宏基因组学相比较，宏转录组学能从转录水平研究复杂微生物群落变化，能更好的挖掘潜在的新基因。
产品优势
 广泛应用于肠道内容物、土壤、水体等研究中
充分挖掘样品中存在的微生物多样性及动态变化情况
高通量覆盖可全面检测生态环境中的微生物信息
应用领域
医药领域：微生物与疾病的关系、分子标记和药物靶点的筛选鉴定等
生态领域：生物互作、微生物制剂的开发等
工业领域：生态能源、环境污染监控与生物修复等
分析内容

原始数据质量控制

mRNA序列组装

物种注释及分类

功能注释（KEGG,eggNOG，CAZy）

Nr数据库比对

GO富集

KEGG富集

多样品比较分析

北京优吉科技有限公司，是基因领域产学研一体的分子实验技术服务公司。以探索生命科学无尽可能为愿景，投资近千万元，构建了完善的分子实验平台，自主产权的项目交互管理系统，大型信息分析计算集群，自主产权项目分析流程，目前正在单细胞测序、数字PCR、大规模分子实验和测序方面开展工作。为国内外高校、研究院、育种和医药单位提供高质量的实验数据结果，加速基因领域发展。