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16S分析；16S测序；微生物群落多样性分析
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| 服务商： 北京阅微基因技术有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
技术简介
指对环境细菌的16S rRNA和真菌的ITS基因序列进行高通量测序。细菌的16S rRNA基因和真菌的ITS基因结构既具有保守性，又具有高变性。通过测序结果与数据库比较，可以分析环境细菌/真菌的菌群结构和多样性。
环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rRNA/ITS高变区的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性及分布特征。
技术优势
简单易操作：环境样品（微生物群落）的最优解决方案，完全摆脱繁杂的菌株分离工作；
准确性高：从碱基保守水平测定，真实反映物种情况；
更为高效：与传统的研究方法相比，具有通量大、产出数据多等优点；
灵活：提供多种可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求。
技术路线图
生物信息学分析
常规分析：
1.测序数据质控分析及序列拼接
2.OTU聚类及其丰度分析
3.OTU物种注释及其丰度分析
4.系统发育树构建
5.Alpha多样性分析（多样性指数计算及稀释度曲线图）
6.Beta多样性分析（距离矩阵分析、PCoA分析及样品聚类分析）
高级分析：
7.样本间显著性差异因子分析
8.特定物种分析
9.基于样本物种分类及环境影响因子的多元统计分析
个性化分析：
10.根据客户需求进行个性化定制分析
案例解析
土壤样品中细菌的组成
采用VAMPS软件分析16S V6区的序列，展示4个不同样本的细菌组分。
（Maltz, Michele A., et al., 2014）
16s rRNA稀释曲线分析
从样本中随机抽出序列数作为横坐标，OTU数量作为纵坐标，每条曲线代表一个样本。稀释性曲线趋向于X轴平行，说明该样本测序量基本充足。
（Lee, On On, et al., 2011）
不同样品菌群结构分析
对16S序列进行分类注释，并计算其相对丰度，累积柱状图揭示不同样品的菌群结构特征。
（Ghai, Rohit, et al., 2012）
细菌16S rRNA基因构建系统发育树
对16S V4区序列进行聚类产生OTU，利用OTU序列构建系统发育树揭示其进化关系，并展示每组OTU聚类的16S V4序列数量信息。
测序策略及数据量
测序策略：PE150、PE250、PE300
建议数据量：4万条reads 或 1M reads
· 分布全国的运营中心、办事处，轻松实现人员的迅速调配；
· 固定技服人员覆盖全国31 个省、自治区、直辖市，加强服务深度，提升客户体验并开通7×24h服务热线，72h内到达客户现场；
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