ChIP-seq

技术简介
    染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代高通量测序技术相结合的ChIP-seq技术，能够高效的在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。ChIP-seq具有精确、灵敏、大量且成本低廉的优点，实现了目标蛋白在全基因组范围内的全部结合位点的定位。

   技术路线图

生物信息学分析

常规分析：
     1. 测序数据质控分析
     2. ChIP-seq序列与参考序列比对
    3. 统计样品中比对位置唯一的序列在基因上、基因间区的分布情况及覆盖深度
    4. 统计样品Peak信息（峰检测及计数、平均峰长度、峰长中位数）
    5. Peak区域的基因组定位
    6. 与Peak区域相关的DNA结合因子分析

     高级分析：
    7.Peak区域相关靶基因功能注释及GO分析
    8.Peak区域相关靶基因的代谢通路（pathway）分析
    9.不同样品Peak区域的差异分析

     个性化分析：
    10.根据客户需求进行个性化定制分析


     案例解析

 

北京阅微基因技术股份有限公司（证券简称：阅微基因，证券代码：873723.NQ）主要从事多基因联合检测产品的研发、生产和销售业务，并基于中等通量基因检测技术平台为下游客户提供技术服务及创新解决方案，产品及服务广泛应用于临床医学、法庭科学、工农业及其他领域。

阅微基因总部位于北京市海淀区中关村科技园区，在北京和苏州均设有GMP生产基地，并在全国设有多个子公司及技术服务中心，2018年阅微基因在哈萨克斯坦成立海外子公司，开始积极拓展海外业务。公司迄今已获数十项发明专利及软件著作权，多年来持续获得国家高新技术企业认证，并荣获2020年北京市专精特新“小巨人”企业称号、工业和信息化部第二批专精特新“小巨人”企业称号。

阅微基因以市场需求为导向，充分发挥在基因检测领域的技术积淀，以“中通量荧光PCR-毛细管电泳平台”为核心技术平台，形成检测设备、检测试剂及软件系统开发和服务等关键能力，致力于重大疾病谱的临床医学领域和法庭科学基因检测领域的技术进步和产品开发，逐渐成为国内基因检测领域具有设备、试剂、软件一体化优势的创新企业。