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凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoreticmobilityshiftassay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结 合序列相互作用的技术
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凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoreticmobilityshiftassay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结 合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和RNA序列的相互作用,已经成为转录 因子研究的经典方法。
当蛋白质与末端标记的核酸探针结合后,SDS–PAGE电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后,用于检测DNA结合 蛋白、RNA结合蛋白,并可通过加入特异性的抗体(supershift)来检测特定的蛋白质,也可进行未知蛋白的鉴定。 | ![]() |
应用方向:
目前,EMSA已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用,已经成为转录因子研究的经典方法。
1、用于研究特定的转录因子以及转录因子所结合的顺势作用元件。
2、用于研究与蛋白质相结合的DNA的序列的特异性。
3、评估突变对探针DNA与结合蛋白相互作用的影响。
说明:
1、细胞核蛋白或纯化的转录因子(部分实验亦可使用重组表达的蛋白),依据实验设计至少提供50ul,浓度大于0.5mg/ml。 |
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