蛋白质组学服务

服务内容：多肽、蛋白质的电喷雾质谱分子量测定以及天然产物、生物大分子、有机分子的质谱测试和数据分析。按样品类型分具体如下：

胶内酶解样品：
样品类型：SDS-PAGE胶条，2-DE 点胶块
肽段制备：脱色 还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Orbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。

酶解后蛋白样品：
样品类型：酶解后溶液肽段或冻干肽段
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。

总蛋白酶解：
样品类型：蛋白溶液或蛋白冻干粉
肽段制备：溶液内全蛋白酶解，还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸；B 84%乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。

送检样品要求:

• 至少提供5-10pmol样本量；如果是干粉，提供10ug，如果是溶液，请提供ug/ul的浓度，体积约30ul。若提供蛋白电泳胶条，请提供相应蛋白染色图像照片；送样时请在样本提交表格中注明样品的品名、来源、溶剂、浓度、目标分子量、联系方式，以及样品是否需要返还等。
• 样品尽量不含无机酸碱、盐、离子表面活性剂、去垢剂及难挥发性盐。如果在样本提取过程中使用高盐、去污剂等化学试剂，请使Pierce PepClean C-18 Spin Columns (Cat. 89873)纯化多肽。
• 酶解过程中所使用DTT可于-20℃冰冻保藏半年；碘乙酰胺(IAA)现用现配,不可重复使用；溶液配制要用Milli-Q级别的水配制；操作过程中要用进口无蛋白枪头和离心管；操作过程勿带乳胶手套，可用PE手套；多肽样品制备好后，可于4℃短期保存3-7天，-20℃保存一个月
• 未知种属请提供相应蛋白质数据库，不提供全新蛋白测序(De novo sequencing)服务。
• 每周五、周六为对外服务时间，可跑样本约26个。每个样本机时两个小时，数据库检索按每个样本复杂程度由30分钟至8小时不等。收到样本的第二周周五出鉴定结果报告。如果质谱仪忙碌，报告时间顺延。
• 可按要求提供DVD数据刻录，本实验中心不负责保留数据。

     杭州沃森生物技术有限公司成立于浙江大学国家大学科技园， 是国内最早一批高通量测序领域知名企业，是一家为科研和精准医学领域提供高品质产品和成本优化解决方案的高新技术公司。公司成立至今已有近十年历史，在分子生物学和基因组学特别是二代测序NGS应用方面有着丰富的经验，拥有强有力的数据处理分析和信息挖掘技术。在西湖科技园，公司组建专业的生物学实验平台和十万级洁净度的GMP标准生产车间，为分子诊断企业提供定制化的试剂解决方案。公司拥有一流技术团队，涵盖生物学、医学、农学、超算计算机学等多个领域的专家，由浙江大学两位海归“千人”教授领衔。公司与各大科研单位、医院、第三方医学检验中心等展开合作，致力于前沿生物学技术在科研和临床诊断中的转化与推广，立志成为一家服务科研及分子诊断行业的高科技公司。公司先后入选杭州市大学生创业企业、高层次留学回国人员在杭创业创新项目、是杭州高新技术企业和浙江省科技型中小企业。公司创始人宋伟杰入选第三期杭州市杰出创业人才培育计划、杭州市西湖区第六届优秀青年科技工作者。