敏芯代谢组学平台介绍
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年,是国内第一家专业提供系统生物学技术服务的高科技公司。敏芯代谢组学平台于2009年开始对外服务,经过近四年的发展,现平台已拥有三大分析测试仪器(包括:GC/MS、LC/MS及NMR),实验室面积近400平米,服务内容包括:样本的制备、谱图的采集、差异代谢物质的挖掘与定性、以及多组学的整合分析等。敏芯代谢组学平台服务的客户已达百余家,合作发表SCI论文10余篇,并成功举办两期代谢组学培训班,共培训学员120余名。
GC-MS分析服务
气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术,采用电子轰击(EI)方式对代谢物组进行分析。本实验平台适宜于分析小分子、易挥发、热稳定、能气化的化合物。我们能提供如下服务:
实验内容:
通过GC-MS分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。
实验阶段:
☆预实验阶段:对相关的实验条件(制备方法、仪器参数等)进行摸索,优化实验方法;
☆正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到质谱图;
数据分析阶段:
对实验得出的原始数据进行数据分析,可以提供的分析包括:
² 数据预处理
² 差异分析
² 主成分分析(PCA)
² 偏最小二乘判别分析(PLS-DA)
² ROC诊断分析
² 预测模型构建
² 多组学整合分析等
合作发表文章实例:
v 复旦大学: Jiaoran Menga, Xiaodong Zhangb, Hao Wuc, Jing Bua, Chenyi Shia, Chunhui Denga,Yu Maob, Morphine-induced conditioned place preference in mice: Metabolomic profiling of brain tissue to find “molecular switch” of drug abuse by gas chromatography/mass spectrometry,Analytica Chimica Acta.2011.IF=4.31
v 中山医院:Hao Wu, Ruyi Xue , Huazong Zeng, Xizhong Shen et al., Metabolomic profiling of human urine in hepatocellular carcinoma patients using gas chromatography/mass spectrometry, Analytica Chimica Acta,648 (2009) 98–104.IF=4.31
v 中山医院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , Metabolomic investigation of gastric cancer tissue using gas chromatography/mass spectrometry , Anal Bioanal Chem. 2010;396(4):1385-95. IF=3.841
v 中山医院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , GC/MS-based metabolomic approach to validate the role of urinary sarcosine and target biomarkers for human prostate cancer by microwave-assisted derivatization.IF=3.78
详情请访问公司网站:www.sensichip.com.cn
bio-equip.com
上海敏芯信息科技有限公司
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月,是国内知名的生物信息学服务提供商。随着业务扩展,公司已经发展成为国内第一家专业提供系统生物学服务的高科技企业,提供包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学相关的实验设计、实验检测、数据分析、结果验证及论文修改的全面解决方案。公司已获得国家及上海市中小企业创新基金、上海市科技创新行动计划、上海市大学生创业基金、上海市专利试点企业、上海市技术成果转化认证、上海市杨浦区人才资助资金等多项国家及省部级奖励。
具体业务包括:
-基因芯片:表达谱芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等实验及数据分析
- 高通量测序:miRNA测序、mRNA测序、基因组重测序、甲基化测序、ChIP-Seq等实验及数据分析
-蛋白质组学:蛋白质芯片(SELDI)、细胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等
- 代谢组学:液质联用(LC-MS)、气质联用(GC-MS)及核磁共振(NMR)的实验及数据分析
- 文献挖掘:提供基于pubmed数据库的关键词搜索服务
- 生物信息培训:定期举办综合性生物信息培训班,并提供上门培训服务及随到随学班
u 专利代理:提供生命科学领域的专利写作、专利润色及专利申请服务
- 实验服务:引物设计、RT-PCR、3730测序、Western Blot、2D-MS等
目前,公司国内外客户已超过500家,合作发表了50多篇高影响因子的SCI(影响因子累计超过100分),并参与多项国家科研项目的申请与实施。