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iTRAQ/TMTﾠ蛋白定量，是通过体外同位素标记方法，对蛋白酶解后的肽段进行标记，从而对多个样品的蛋白质进行相对定量分析。
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利用质谱仪开展的蛋白组学研究中，质谱的扫描速度会影响蛋白的鉴定深度。引入双TIMS/PASEF®ﾠ(Parallel Accumulation - SErial Fragmentation平行累积串行碎裂)分离技术的timsTOFﾠPro平台使得蛋白质组学进入了4D蛋白质组学新时代。传统的3D分离技术包括保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity），4D分离技术增加了第四个维度—离子淌度（mobility），进而大幅度的提高了扫描速度和检测灵敏度，大幅提升蛋白鉴定的数量和覆盖率。
timsTOFﾠPro创新性地使用了双TIMS分离/富集装置，离子在第一个TIMS部分中进行累积，在第二个TIMS中根据淌度进行分离，经过分离后的离子继续用于MS/MS碎裂。往复进行此过程，当第二个TIMS进行分离时，第一个TIMS也同时在平行地累积离子，这样可以实现近乎100％的离子利用率，减少1价离子（杂离子）的干扰。
iTRAQ/TMTﾠ蛋白定量，是通过体外同位素标记方法，对蛋白酶解后的肽段进行标记，从而对多个样品的蛋白质进行相对定量分析。每种标记都包含报告基团、质量平衡基团和多肽反应基团，三种基团分子量之和相等，使得不同样品的相同类型肽段的质荷比相同。在经过二级质谱时，质量平衡基团丢失，报告基团会产生不同的报告离子。通过检测该离子的信号强度即可得到不同样品间同一肽段的定量信息。与非标记定量技术相比，标记定量的灵敏度更高，可重复性好。
timsTOFﾠPro创新性地使用了双TIMS分离/富集装置，离子在第一个TIMS部分中进行累积，在第二个TIMS中根据淌度进行分离，经过分离后的离子继续用于MS/MS碎裂。往复进行此过程，当第二个TIMS进行分离时，第一个TIMS也同时在平行地累积离子，这样可以实现近乎100％的离子利用率，减少1价离子（杂离子）的干扰。
iTRAQ/TMTﾠ蛋白定量，是通过体外同位素标记方法，对蛋白酶解后的肽段进行标记，从而对多个样品的蛋白质进行相对定量分析。每种标记都包含报告基团、质量平衡基团和多肽反应基团，三种基团分子量之和相等，使得不同样品的相同类型肽段的质荷比相同。在经过二级质谱时，质量平衡基团丢失，报告基团会产生不同的报告离子。通过检测该离子的信号强度即可得到不同样品间同一肽段的定量信息。与非标记定量技术相比，标记定量的灵敏度更高，可重复性好。
实验流程
蛋白提取、质检 ——> 蛋白酶解 ——> 标签标记 ——> LC-MS/MS上机 ——> 原始数据质控、分析
样品要求
// 细胞：5×106个细胞；
// 动物组织：200mg；
// 植物组织：800mg；
// 微生物：400mg；
// 血清血浆：300μl
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