DAP-seq成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高 DNA Binding Site发现的效率。
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传统的ChIP-seq 是进行体内检测 TFBS 的主要方法,繁琐步骤和材料需求阻拦了很多科研进程。
DNA亲和纯化测序方法,成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高 DNA Binding Site发现的效率。
DAP-seq不仅能够超高通量查找TFBS,还能深入了解众多TF的生物学特性和结合位点结构,在任何有机体的顺反和表观研究中表现出巨大的价值。
具体方法为:通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组 DNA 文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的 DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。