DAP-seq效应因子、转录因子、调控因子、未知蛋白结合位点

在基因组水平上，鉴定转录因子的结合位点（transcription factor binding sites, TFBS）非常重要。ChIP-seq是进行体内检测TFBS的主要方法。然而，ChIP-seq依赖于抗体质量，这对低表达的蛋白质具有很大的挑战性。所以，ChIP-seq通常在规模上受到限制，难以进行高通量扩展。因此，只有少数转录因子可以获得结合位点信息，大量TFBS的覆盖范围仅适用于人类和一些模式生物。
DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术，表达出带有标签的转录因子，和基因组DNA文库在体外进行结合，然后分离出所有与转录因子结合的DNA，再使用高通量测序，找到转录因子的结合位点。 
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DAP-seq的优势
与ChIP-seq相比，DAP-seq不需要针对每个转录因子制备特异性抗体。具有快速、高通量、节约时间成本的优势，并且适用于所有的真核生物。
 
蓝景科信提供DAP-seq全流程技术服务+个性化数据分析，具有丰富的技术服务经验。
已经做过的材料包括：拟南芥，水稻，小麦，玉米，大豆，苜蓿，百脉根，菜心，枣，荔枝，香蕉，毛果杨，胡杨，油松。

技术服务：
1、DAP-seq：高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点。
2、酵母单杂交：研究蛋白质和特定DNA序列相互作用。
3、酵母双杂交：检测已知蛋白质之间的相互作用，鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。
4、EMSA：鉴定或验证DNA结合蛋白和DNA序列的相互作用。
5、ChIP-seq：高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点。
6、DAP-seq与RNA-seq联合分析： 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化，深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据，增加转录组测序的分析深度。
7、DNA-pull down：鉴定与DNA结合的蛋白。
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