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ChIP-on-Chip 嵌合芯片技术服务
Tiling Array(中文译为“嵌合芯片”)是迄今为止分辨率最高的基因芯片类型,Tiling Array的探针设计几乎涵盖了目标DNA的全部序列。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:5414
最后更新:2015-1-16半年访问:16
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服务描述
GeneChip® Tiling Array 技术简介
Tiling Array(中文译为“嵌合芯片”)是迄今为止分辨率最高的基因芯片类型,Tiling Array的探针设计几乎涵盖了目标DNA的全部序列。目前为止,Affymetrix公司已经开发出了人、小鼠、酵母、线虫、拟南芥等模式生物的全基因组Tiling芯片,为全基因组规模上研究目的蛋白与核酸的相互作用提供了强有力的分析工具。

GeneChip® Tiling Array除了全基因组芯片外,还包括了专门应用于ChIP-chip技术中的人启动子和小鼠启动子两款芯片,探针设计覆盖了转录起始位点附近10kb的范围,针对肿瘤相关的1300个基因中,覆盖范围更增加到12.5kb。

此外,Affymetrix公司提供了包括GCOS, TAS和IGB在内的完整的数据处理体系,为客户发表高质量的文章提供了强有力的保障。


服务流程
★ 客户需要提供足够量生物样品和具有ChIP活性的转录因子的抗体
★ 对生物样品进行甲醛交联
★ 超声破碎基因组DNA
★ 染色质免疫共沉淀
★ 荧光标记
★ 芯片杂交
★ 芯片扫描
★ 数据分析
★ 数据保存和结果报告

服务优势 ★ 高通量:一次实验可以完成某个转录因子对全基因组范围内的2万多个基因的转录调控研究,如果选择全基因组嵌合芯片,可以考察某个DNA结合蛋白的结合位点在全基因组的分布情况。
★ 品种全:物种包括了人、小鼠、线虫、酵母、拟南芥、果蝇等诸多模式生物。
★ 严谨的数据处理体系:Affymetrix公司提供了包括GCOS, TAS和IGB在内的完整的数据处理体系,为客户发表高质量的文章提供了强有力的保障。
★ 强大的文章支持:Affymetrix公司在Nature,Cell等顶级杂志上发表了多篇Tiling Array应用方面的高质量文章。
★ 专业的服务队伍:本公司的ChIP-Chip技术平台上投入了多位分子生物学和生物信息学的专家,除了为客户提供全方位的服务外,还可参与到对方的实验设计之中,为发表高质量的文章献计献策。

参考文献
· Carroll J, et al. Chromosome-Wide Mapping of Estrogen Receptor Binding Reveals Long-Range Regulation Requiring the Forkhead Protein FoxA1. Cell, Vol. 122, 33-43, July 12, 2005.
· Cawley S et al., Unbiased mapping of transcription factor binding sites along human chromosomes 21 and 22 points to widespread regulation of noncoding RNAs. Cell. 2004 Feb 20;116(4):499-509. PMID: 14980218.
· Bernstein B et al. Genomic Maps and Comparative Analysis of Histone Modification in Human and Mouse. Cell Vol 120, 169-181. January 28, 2005.
· Bernstein B et al. A Bivalent Chromatin Structure Marks Key Developmental Genes in Embryonic Stem Cells. Cell. 2006 April 21; 125: 315-326.

订购信息
产品编号. 产品名称 产品描述
AFFY-900775 GeneChip® 人启动子 1.0R 芯片服务 25,500个基因,1张芯片
AFFY-900774 GeneChip® 人Tiling 1.0R 芯片服务 14张芯片
AFFY-900772 GeneChip® 人Tiling 2.0R 芯片服务 7张芯片
AFFY-900543 GeneChip® 人ENCODE11.0F芯片服务 1张芯片
AFFY-900544 GeneChip® 人ENCODE11.0R芯片服务 1张芯片
AFFY-900545 GeneChip® 人染色体21/22 1.0F芯片服务 3张芯片s
AFFY-900546 GeneChip® 人染色体21/22 1.0R芯片服务 3张芯片
AFFY-900936 GeneChip® 人染色体21/22 2.0F芯片服务 1张芯片
AFFY-900889 GeneChip® 小鼠启动子 1.0R 芯片服务 25,500个基因,1张芯片
AFFY-900853 GeneChip® 小鼠Tiling 1.1R 芯片服务 14张芯片
AFFY-900852 GeneChip® 小鼠Tiling 2.0R 芯片服务 7张芯片
AFFY-900594 GeneChip® 拟南芥Tiling 1.0R 芯片服务 1张芯片
AFFY-900935 GeneChip® 线虫Tiling 1.0R 芯片服务 1张芯片
AFFY-900645 GeneChip® 酿酒酵母Tiling 1.0R 芯片服务 1张芯片
AFFY-900647 GeneChip® 裂殖酵母Tiling 1.0FR 芯片服务 1张芯片
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