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晶芯®转录因子活性谱芯片技术服务
转录因子是细胞内一类重要的基因表达调控蛋白,它通过与基因上游启动子区中特异的DNA序列的相互作用,来决定被调控基因的开启和关闭以及表达量。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:4787
最后更新:2015-1-16半年访问:32
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服务描述
转录因子是细胞内一类重要的基因表达调控蛋白,它通过与基因上游启动子区中特异的DNA序列的相互作用,来决定被调控基因的开启和关闭以及表达量。一个转录因子可调控数百个基因的表达,而一个基因的表达又可受数个转录因子的调控。转录因子的结构和功能缺陷,与人类的一些疾病(如肿瘤和炎症)相关,许多转录因子还是药物作用的靶点。所以,转录因子活性的检测对疾病的研究和药物开发都非常有意义。转录因子活性谱芯片是基于博奥独创的专利技术OATFA(Oligonucleotide Array-based Transcription Factor Assay)所开发的一种新型分析芯片。OATFA技术结合了凝胶滞留和DNA微阵列的优点,实现对转录因子蛋白的快速、高通量检测,可对细胞中上百种转录因子活性状况进行考察,给出细胞中某一时刻转录因子活性状况的全景图。

样品接收单表格下载:
1、博奥转录因子活性谱芯片样品接收单

产品特点
★ 探针设计来源于商品化的TRANSFAC数据库(BIOBASE),采用模拟退火(Simulated Annealing)的优化算法,最大限度的排除了交叉结合和交叉杂交的可能性
★ 点阵设计中加入了多种质控对照点,包括阳性对照和阴性对照,保证了实验结果的准确可靠
★ 人源转录因子活性谱芯片共包括280条转录因子结合序列,可以同时检测270多种转录因子。与小鼠的同源性高达70%,与大鼠的同源性为40%;酵母转录因子活性谱芯片可以检测酵母全基因组规模的96种转录因子
★ 优化的高保真单引物线性扩增的方法(SPA),在提高灵敏度的同时,严格遵守探针之间原有的定量关系

服务流程
★ 生物样品(组织或细胞)
★ 抽提核蛋白,蛋白浓度测定
★ 核蛋白与转录因子结合序列(Probe Mix)的混合物共同孵育
★ 分离回收与核蛋白中转录因子发生结合的Probes
★ 扩增并荧光标记
★ 芯片杂交
★ 芯片扫描
★ 数据分析
★ 数据保存和结果报告

服务优势
★ 高通量:一次实验可以完成上百种转录因子的活性检测,可大大降低逐一检测的成本
★ 高灵敏度:在标记过程中引入了扩增技术,使检测灵敏度有了显著的提高
★ 准确:成对样本可以在同一张芯片上进行杂交分析,提高了检测结果的准确性
★ 重复性好:由于采用了优化的实验流程和辅助工具,使实验结果的重复性R>0.95
★ 严格的质控:为了保证实验结果的可靠性,芯片上设计了多种质控参照
★ 强有力的文章支持:本芯片是由我们公司自主研发的服务平台,该技术的探索性文章(OATFA技术)就发表在Journal of Proteome Research(IF>6)上,后续的生物应用文章正在向更高质量的杂志投稿
★ 专业的服务队伍:转录因子活性谱芯片技术服务的负责人就是该技术的创始人之一,对整个平台的细节及该技术的国际进展有很强的把握能力,提供技术服务的同时可以给予客户更深层次的建议

参考文献
· Shao, W., Wei, H., Qiao, J., Zhao, Y., Sun, Y., Zhou, Y. and Cheng, J. (2005)."Parallel profiling of active transcription factors using an oligonucleotide array-based transcription factor assay (OATFA)"Journal of Proteome Research, 4(4): 1451-1456. (链接文献)

订购信息
产品编号 服务名称 转录因子数
230010 晶芯® 人转录因子活性谱芯片服务 270
230020 晶芯® 酵母转录因子活性谱芯片服务 96
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