服务描述
ChIP-GLAS启动子芯片技术服务是美国ASB公司开发出的世界领先的GREMATM(Gene Regulatory Elements Mapping and Analysis)技术,在染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP)的应用中处于领先地位。博奥生物通过与ASB的合作,将GREMA技术引入中国,独家为中国广大的生命科学研究人员提供高质量的ChIP-GLAS技术服务。
染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP)研究也称结合位点分析法,它采用微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌症、心血管疾病以及中央神经系统紊乱等疾病的主要代谢通路的一种非常有效的工具。染色质免疫共沉淀技术与芯片技术相结合(ChIP-on-chip)更有助于科学家发明疾病的有效治疗方法。调控蛋白与基因组DNA结合能够控制DNA复制和基因表达,作为细胞调节网络中的开关,结合位点分析信息与基因表达数据相结合,将能有助于分析寻找生物标志物(biomarker)。转录因子通过与核酸直接的相互作用等方式在细胞内发挥着重要的转录调控作用。它们通常序列特异性地结合在基因转录起始位点上游的启动子区来调节该基因的转录。而ASB的启动子芯片技术则是用于检测单个转录因子在细胞中的某一时刻与20,000个基因启动子相互作用的情况。通过染色质免疫共沉淀(ChIP)技术和启动子芯片的有机结合,可以确定任何一个特定转录因子的靶基因群。
产品特点
该产品的核心技术ChIP-GLAS技术是由加州大学圣地亚哥分校(UCSD)付向东教授的研究小组开发,并被选定为美国国立卫生研究院(NIH)ENCODE计划中技术发展期的主要技术之一。
该产品特点除了操作简单,成本低之外,还包括:
★ 容易地与经典的DNA微阵列芯片技术和结果整合,操作方便
★ 涵盖20000个功能基因的启动子序列
★ 固定在芯片上的每条探针是40nt的寡核苷酸序列,每个探针对应一个基因
★ 采用独特的ChIP-GLAS技术,特异性大大提高,灵敏度比传统ChIP-Chip技术高2-3个数量级
★ 一次实验可以完成被检测的转录因子对20000个基因的转录调控分析
服务流程
★ 客户需要提供生物样品和具有ChIP活性的转录因子的抗体
★ 对生物样品进行甲醛交联
★ 超声破碎基因组DNA
★ 染色质免疫共沉淀
★ 荧光标记
★ 芯片杂交
★ 芯片扫描
★ 数据分析
★ 数据保存和结果报告
服务优势
★ 高通量:一次实验可以完成被检测的转录因子对全基因组范围内的2万个基因的转录调控研究
★ 高灵敏度和高特异性:与传统ChIP-Chip技术中的标记方法(LM-PCR)不同,本芯片采用了GLAS(Guided Ligation And Selection)标记技术,使检测灵敏度提高了3个数量级,同时特异性也得到了显著的增强
★ 严格的质控体系:为了保证实验结果的可靠性,从基因组DNA超声片断的大小到染色质免疫共沉淀的成功与否都有完善的质控措施
★ 专业的服务队伍:本公司的启动子芯片技术平台上投入了多位分子生物学和生物信息学的专家,除了为客户提供全方位的服务外,还可参与到对方的实验设计之中,为发表高质量的文章献计献策
参考文献
· Ren B, Robert F, Wyrick JJ, Aparicio O,Jennings EG,Simon I, Zeitling J, Schreiber J, Hannett N, Kanin E,Volkert TL, Wilson CJ, Bell SP, Young RA.(2000). Genome-wide location and function of DNA binding proteins. Science.290(5500):2306-9
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· Ren B, Cam H, Takahashi Y, Volkert T, Terragni J, Young RA, Dynlacht BD. (2002). E2F integrates cell cycle progression with DNA repair, replication, and G(2)/M checkpoints. Genes and Development. 16(2):245-56
· Li Z, Van Calcar S, Qu C, Cavenee WK, Zhang MQ, Ren B.(2003). A global transcriptional regulatory role for c-Myc in Burkitt´s lymphoma cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100(14):8164-9
· Blancafort P, Magnenat L, Barbas CF 3rd..(2003). Scanning the human genome with combinatorial transcription factor libraries. Nature Biotechnology. 21(3):269-74
订购信息
ChIP-GLAS系统包括微阵列芯片和试剂盒两部分,可以单独购买。
产品编号 服务名称
ASB-F0003 ChIP-GLAS-H20K
ASB-F0006 GLAS-20K-chip
ASB-F0009 GLAS-H20K
bio-equip.com