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生物芯片分析软件MicroVigene™
MicroVigene™是一款完整的生物芯片的单机镜像分析软件, 它集成了图像显示、镜像分析、数据分析和可视化显示等工具。在图像分析方面具有准确性高,灵敏度强,分析结果可靠,分析过程高度的全自动化。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:664
最后更新:2017-3-28半年访问:5
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  • 服务介绍
  • 公司简介
产品特点
图像方面的特点
支持各种类型的图像格式(支持分析标准的16位灰度图,包括TIFF文件、MD 文件,Bmp文件、JPEG文件和Fuji文件等格式的任何生物芯片扫描仪生成的芯片图) 
支持双通道生物芯片图像分析 (Cy3、Cy5) 
支持图像翻转 ,放大缩小等基本的图像操作 ,用户可以设定图像显示(对比度,图像映射关系),对图像可以进行重采样 
支持分析圆形样本点和方形样本点 
支持所有常见的生物芯片微阵列图,而且支持桔子型(orange)阵列图 ,而且支持基于Plate的孔板型微阵列图
可以自动识别条形码 
可以粘合多张芯片图 
三维显示图使图像显示更直观 ,更能帮助用户图像分析的质量;并且能帮助用户识扫描出来的芯片图的质量,比如是否有过饱和样本 

可视化的图像分析工具
3D视图显示样本点的背景本底和杂质 
图像分析结果图和数据可以保存下来在其他应用程序中使用 
可以显示样本点的柱状图和任何一块区域的像素分布柱状图 
分析结果中提供结果数据表,每一个样本点有30个结果数据 

图像分析的特点
分析时间短,分析操作简单 ,分析过程仅需要鼠标点击一下就能全自动的完成整个图像分析过程,并得到最后的图像分析结果 
具有准确和稳定的分析结果 ,准确的定位真实的样本点 
灵活的栅格定位,会提高分析的灵敏度来获取特殊的或者信号很弱的样本点
优越的镜像分析算法,对于各种类型的生物芯片图都能准确的获取其真实的样本信号强度 
准确的信号校准,自动去除背景本底,去除杂质 
支持分批自动分析和自动保存结果数据 
样本质量控制方面可以手动或者自动去除质量差的点 

图像分析结果和结果数据处理
分析结果数据进一步处理,包括数据相关分析,双通道各自像素值和Ratio值,样本P值计算,双通道MA散点图 
图像分析结果数据可以按照用户需要输出最后结果,每个样本点分析结果包括30个数据有生物芯片分析比较常见的Mean_net, Median_net, Vol_net ,Background,双通道的ratio值等

图像分析自动化体现
图像分析过程中,过程全自动化,自动分块,自动定位栅和自动找信号点 
样本点质量控制,自动去除本底和杂质,自动提取每个样本的信号值 
批处理自动分析一组生物芯片微阵列图
自动识别过饱和信号点和弱信号点 

产品性能
功能扩展性强,可以满足不同用户、不同特点图像的数据提取 
数据重复性都好,重复分析得到的数据很稳定 
准确性高,对于找点的准确性和数据提取具有比较高的准确性 
能分析的最大图像大小达到300M左右
根据图像信号强弱和样本点数的数量差异,分析时间大致 在2分钟之内

应用领域
该生物芯片镜像分析软件适用于各种生物微阵列芯片的镜像分析 
  生物芯片分析软件









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