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【功能代谢组学】新式利器【回归分析】
【回归分析】是功能代谢组学研究的重要工具,通过建立回归模型可考察组学多元变量数据与功能、质量、等级等宏观数据之间的关联,从而实现筛选重要变量、建立评价标准和预测结果等目的。
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最后更新:2022-3-24半年访问:22
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功能代谢组学的新式利器【回归分析】已经默默的开展了一个多月了,以低至5000元/组的劲爆价格,常规快到3个工作日的极短周期,受到了大家的一致好评。

科普:

【回归分析】是功能代谢组学研究的重要工具,通过建立回归模型可考察组学多元变量数据与功能、质量、等级等宏观数据之间的关联,从而实现筛选重要变量、建立评价标准和预测结果等目的。

应用场景:

临床诊断:分析发病过程中趋势性变化的代谢物,获得潜在的诊断标志物或治疗靶点;

质量评价:筛选出影响质量、感官等的关键代谢物,获得评级和优化的线索;

药效:从成分复杂的样本中寻找最关键的生物活性物质、快速解析物质功能;

生产:分析不同产量、质量生产过程,明确关键生产条件和优化策略。

 

分析案例图表示例:

图1 OPLS模型得分图(颜色为分组信息) 

 

图2 随机置换检验

 

图3 模型预测值与实际检测值对应图

 

图4 回归模型载荷图(用颜色表征VIP值,偏暖色区域VIP较高)

 

图5 回归模型VIPpre>1物质散点图(可生成表格)

 

图6 回归模型S-plot(用颜色表征VIP值,偏暖色区域VIP较高)

 

表 OPLS模型参数

 

模型的建立和功能:

 

正交偏最小二乘回归(OPLS)分析模型:
使用SIMCA 14.1中的OPLS模块,建立正交偏最小二乘回归分析模型。通过建立数学模型,实现由X数据组中的各变量与回归目标Y建立误差最小的拟合方程式。基于正交算法的过滤,在模型拟合时可排除与Y无关的变量,从而可对目标生物现象或过程进行更深刻的解读,发现与回归目标Y最重要的变量X;同时,由已建立的方程式,可通过新样本的X数据预测出其Y值。使用SIMCA 14.1时,也可同时对多个Y值进行模型拟合和分析。

回归分析可获得的结果如下:
OPLS模型得分图(Score plot)、置换检验(Permutation test)和预测-实际值回归线;
OPLS模型载荷图(Loading Plot)、变量VIP(variable importance)值和S-plot;
新样本数据预测(需通过SIMCA 14.1中Predict模块实现)。

模型功能:
通过模型质量,反映数据组与目标参数相关程度;
通过建立实际值与预测值的散点图,反映回归模型的预测能力(包括误差分析);
通过VIP值等变量分析工具,从众多变量中筛选出影响比较大的变量,作为后期优化、考察的对象;
通过使用SIMCA中的预测功能,对预测集数据及新检测样品的目标值进行预测分析(包括预测误差分析)。

数据结构要求:

回归分析所需数据如下:
组学数据(X):样本中代谢物组信息(相对含量、绝对含量或信号强度)或过程参数(温度、转速、pH等检测值);
目标数据(Y):宏观生物学的数据,如:临床血常规数据、存活率、基因表达、蛋白表达等各种分子生物学或细胞生物学数据;也可为实验条件或过程变量,如时间、不同给药量、不同培养条件等。

其他参考文献:(如需以下相关文献请点击)

Yao K, Wang J, Zhu C, et al. Results of Different Quantitative Diagnosis Analysis on the Symptoms and Signs of Blood Stasis Syndrome in Coronary Heart Disease [J].World Science & Technology, 2009, 11(5):684-688.

Wu C, Hua Z, Van W G P, et al. Metabolomics-guided analysis of isocoumarin production by Streptomycesspecies MBT76 and biotransformation of flavonoids and phenylpropanoids [J]. Metabolomics, 2016, 12(5):90.

Zhang Q, Wang J, Zhang C, et al. The components of Huang-Lian-Jie-Du-Decoction act synergistically to exert protective effects in a rat ischemic stroke model [J].Oncotarget, 2016.

Jing J, Shi Y, Zhang Q, et al. Prediction of Chinese green tea ranking by metabolite profiling using ultra-performance liquid chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry (UPLC-Q-TOF/MS) [J]. Food Chemistry, 2017, 221:311-316.

Li S, Sullivan N L, Rouphael N, et al. Metabolic Phenotypes of Response to Vaccination in Humans[J]. Cell, 2017, 169(5):862-877.

 

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