lncRNA测序

欧易特色

● 技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993
● 高特异性：使用特定方法降低样本中rRNA的丰度
● 高准确度：构建链特异性转录组文库，快速、高效、准确地获取样本中几乎全部的lncRNA序列及其位置信息
● 分析严格：系统鉴定已知lncRNA，设置严格的筛选条件用于发现新的lncRNA
● 独具特色的lncRNA高级分析：lncRNA cis和trans调控机制以及ceRNA调控机制等
● 经验丰富：已对多种动植物的lncRNA进行测序分析

lncRNA测序项目流程

推荐测序模式

● Hiseq4000, PE150 

● 一般测序：10 Gb/样本 

● 深度测序：20 Gb/样本

数据分析内容

标准数据分析

● 原始测序数据质控   ● 测序数据质量评估

● Reads污染检测   ● 参考基因组比对

● 转录本重建/组装分析   ● 潜在长链非编码RNA挖掘

● 长链非编码RNA特征分析   ● lncRNA表达量分析

● 差异表达分析

高级数据分析

● lncRNA-mRNA共表达分析  ● ceRNA分析

● lncRNA cis、trans分析  ● WGCNA分析

lncRNA测序样品要求

● Total RNA：≥2 μg 

● OD260/280为1.8-2.2

● 适用范围：有参考基因组物种