生物信息学服务

服务介绍

    高通量测序技术（High-throughput sequencing）是指一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定，又称之为“下一代”测序技术（"Next-generation" sequencing technology）或“第二代测序技术”，其核心思想是边合成边测序。

服务流程
1 DNA或RNA提取
2 文库构建
3 上机测序
4 数据分析

服务列表

项目	明细	周期
转录组水平	mRNA测序	45天
	小RNA测序	45天
	LncRNA测序	2个月
基因组水平	外显子测序	45天
	全基因组测序	45天
	动植物de novo测序	根据数据量而定
	微生物de novo测序	根据数据量而定
表观组水平测序	全基因组甲基化测序	根据数据量而定
	ChIP-seq测序	45天
META类	宏基因组测序	45天
	宏转录组测序	2个月
	16S/ITS/18S rDNA等扩增子测序	45天

 
测序平台：HiSeq4000，HiSeq2500，HiSeqX和MiSeq

数据分析内容（以真核转录组测序为例）
标准数据分析
1) 对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads 的处理
2) 参考基因组比对
3) 进行基因表达定量分析
4) 可变剪切分析（真核）
5) 新转录本预测：新mRNA和新lncRNA预测
6) 差异表达基因分析（2个或者2个以上的样本）
7) 差异基因的表达模式聚类分析
8) 差异基因的GO功能富集分析和KEGG PATHWAY富集分析
9) 差异基因的蛋白互作网络分析
10) SNP分析
高级数据分析
lncRNA-mRNA表达关联性分析，及网络图构建；
转录调控网络分析，及网络图构建和重要TF分析；
通路交互网络分析，重要通路分析。
差异表达基因共表达分析，构建网络图
转录因子活性分析，预测最重要的转录因子；
基因共上游调控元件预测
miRNA预测，预测调控靶基因的重要miRNA
主成分分析
药物小分子预测分析（适用于人类），得到最相关的药物小分子。

说明：不同的测序方法不同的分析内容，具体请来电咨询