lncRNA芯片技术服务

lncRNA 特征                 

    1. 结构特征：lncRNA长度大于200nt，具有mRNA样结构，部分具有poly(A)尾巴；
    2. 组织特异性：不同组织之间的lncRNA表达量不同；
    3. 时空特异性：同一组织或器官在不同生长阶段，其中的lncRNA表达量也会变化；
    4. 调控多样性：lncRNA可从染色质重塑、转录调控及转录后加工等多种层面实现对基因表达的调控；
    5. 亚细胞定位：lncRNA的亚细胞位置也呈多样化，在细胞核、细胞质和细胞器均有分布；
    6. 疾病特征性：lncRNA在肿瘤与其它疾病中有特征性的表达方式。

lncRNA芯片技术服务                 

1. Agilent lncRNA芯片                 

芯片具体信息介绍:                 

     华盈生物基于Agilent G3平台最新设计的人类表达谱芯片，除了涵盖32,776条Entrez Gene RNAs的探针外，更设计了78,243条lncRNA探针，lncRNA数据库来源于Broad Institute、 Human Body Map lincRNAs、TUCP catalog、UCSC lincRNAs Transcripts、GENCODE 18、NONCODE V4.0、Ensembl、RefSeq、Ultra-conserved region encoding LncRNA (UCR)、lncRNAdb、ncRNA等多个数据库。

     华盈生物基于Agilent G3平台最新设计的小鼠表达谱芯片，除了涵盖39,430条Entrez Gene RNAs外，更涵盖了约51,302 条lncRNA，lncRNA数据库来源于NONCODE V3.0、Ensembl、 RefSeq、Ultra-conserved region encoding IncRNA (UCR)> lncRNAdb、ncRNA 等多个数据库。

      华盈生物基于Agilent G3平台最新设计的大鼠表达谱芯片，除了涵盖约30,000条Entrez Gene RNAs外，更涵盖了约10,000条lncRNA，lncRNA数据来源于航天医学基础与应用国家重点实验室的大鼠lncRNA测序数据，及 Ensembl、RefSeq、Ultra-conserved region encoding lncRNA (UCR)、lncRNAdb、lncRNA等多个权威公共数据库。

2. Affymetrix lncRNA芯片                 

芯片具体信息介绍:                 

     GeneChip® Human Transcriptome 2.0 (HTA2.0)为Affymetrix最新开发的高密度探针芯片。这一高分辨率芯片包含了超过六百万条不同探针，覆盖编码和非编码转录本。该芯片上70%的探针覆盖编码转录本的外显子，其余30%的探针覆盖外显子之间的剪接位点和非编码转录本。芯片设计和注释的数据来源于 RefSeq、Ensembl、UCSC、Vega、MGC (v10)、NONCODE、lncRNA db和Broad Institutee, Human Body Map lincRNAs and TUCP catalog等多个权威公共数据库。

lncRNA芯片服务特色                 

1. 信息全、新：覆盖了多个权威数据库新lncRNA信息，涵盖全面的lncRNA序列和mRNA信息；

2.物种丰富：包含人、大鼠、小鼠lncRNA芯片，其他物种可以进行芯片定制；

3.可同时检测lncRNA和mRNA：在同一张芯片上对lncRNA和mRNA进行检测，挖掘二者之间的关联；
4.产品质量有保证：Agilent和Affymetrix公司均为基因芯片领域的一线品牌，其芯片产品经历多年的实践检验，品质有保证。
5.独特的技术优势：相比高通量测序方法，基因芯片进行lncRNA研究具有实验周期短、冗余数据少、分析便捷的优势。
6.特色数据分析服务：华盈生物与美国高校院所进行合作，开发了一套深度挖掘lncRNA的功能机制的特色分析体系；同时还提供lncRNA定量PCR服务，完成lncRNA研究的一站式服务。

lncRNA芯片数据分析流程