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代谢组学（Metabolomics）的概念最早由英国 Nicholson于1999年提出，是系统生物学的有机组成部分。代谢组学旨在对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。代谢组学的研究对象大都是相对分子质量小于1000小分子物质，它们参与到生物体的新陈代谢和生长发育的方方面面，是生物现象的最终产物。
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相比基因组和蛋白组的研究，代谢组学研究具有独特的应用优势：1. 基因和蛋白表达的微小变化可通过代谢酶的催化反应在代谢物上得以放大，从而使检测和分析更加容易；2. 代谢物的变化除了反应基因组变化外，还受到环境因素、肠道菌群的影响，其动态性更强，对生物体变化的反映更加灵敏（如上图）；3. 代谢反应及终产物在各个物种的生物体系中都是类似的，因此，代谢组学方法学通用性更强；4. 代谢组学的技术不需建立全基因组测序及大量表达序列数据库，直接对几乎可以对所有样本类型进行检测，包括全血、血浆/血清、组织、细胞、细胞培养上清、尿液、粪便、食物、唾液、脑脊液、脂肪等。
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经过近20年的发展，代谢组学的研究技术手段逐步成熟。目前质谱技术：气质联用技术（GC-MS）和液质联用技术（LC-MS），已逐步取代核磁技术（NMR），成为代谢组学研究的主流技术。GC-MS和LC-MS在其所检测的代谢物谱上各有偏向性（如下图），一般情况两种技术联合使用是常规全谱代谢组分析的主要实验策略。
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技术路线：
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样品要求：
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代谢组的差异变化是基因组变化放大效应的呈现，不同个体中代谢物的波动性也就较大。另一方面，代谢组学的差异分析一般是基于PCA和PLS-DA等多元统计分析方法进行的，只有较大的样本量抽提出的主成分才具有群体代表性。因此，相对于基因组学等技术方法，代谢组学要求样品的生物学重复要更多。
1.细胞样品大于6例
2.临床标本大于30例
3.模式动物样品大于10例
4.植物微生物样品每组大于8例
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应用方向：
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1.疾病标志物开发
2.肿瘤/癌症
3.代谢疾病/心血管疾病
4.营养学
5.炎症/免疫
6.感染性疾病
7.神经科学
8.植物学
9.药物开发
10.毒理研究
11.微生物研究
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相关文献：
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转录组与代谢组联合分析
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Li H, Xie Z, Lin J, et al. Transcriptomic and metabonomic profiling of obesity-prone and obesity-resistant rats under high fat diet. J Proteome Res, 2008; 7(11): 4775-4783.
疾病标志物研究
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