生物信息科学数据共享平台
生物信息科学数据共享平台是上海研发公共服务平台建设专项资助的项目。共享平台集成生物医学基础数据,建设有效、安全、可持续发展的生物医学数据汇交、管理和共享的服务平台。
数据中心已经初步建立了数据服务相关的多种系统:1)在线/离线提交系统,接受用户通过Web或者FTP工具提交的指定格式的生物学数据;2) 数据提取转换加载系统,处理符合格式要求的数据,加载到关系型数据库中;3)BioEngine生命科学数据查询系统,接受Entrez查询语法的查询请 求,以灵活的方式展现查询结果,并提供实时下载服务;4);数据采集系统,从外部数据资源定期采集所需的数据,并保存为本地文件;5)应用程序包装系统, 包装本地应用程序,提供web service访问接口;6)用户注册和管理系统,满足系统和用户的权限管理需求。依托这些服务系统,数据中心能够提供多种数据资源的相关服务,包括普通 核酸、EST、STS、GSS、Trace和SRA等核酸数据,物种数据,引物数据和蛋白质数据。此外,数据中心还采集了大量生物医学研究领域的知名刊物 网站上发布的文献补充材料,在HotData数据资源中提供了这些补充材料的查询和下载服务。除了生命科学数据中心网站的基础数据资源建设外,我们还建设 了以血吸虫为代表的生命科学主题数据库与特色数据库。相关数据服务网站位于http://lifecenter.sgst.cn。
技术基础
生物信息科学数据共享平台是一个典型的JavaEE应用系统,n层体系结构。使用的主要框架和技术包括Struts、Spring和 Hibernate,此外,还通过包装本地应用程序提供Web Service访问接口的方式实现本地应用程序的Web调用。后台数据库包括Oracle 10g和mySQL等。
服务方式
数据中心在开发生物信息科学数据共享平过程中,积累了大量的生命科学数据库开发经验。目前能够承担的任务包括:
生命科学相关的数据库设计:根据用户的愿望,设计出合理的数据库应用原型,提供设计说明书;
生命科学相关的数据库开发与维护:根据设计说明书,开发稳定可靠的数据库应用系统,并能够根据数据的特点制定维护计划,提供安装说明书和维护说明书;
数据采集服务:能够根据用户的需求,从外部数据资源采集数据;
数据库应用系统托管服务:按照用户的要求和说明书,托管用户的数据库应用系统。
bio-equip.com
无锡众信科技有限公司(Shorigen Technology Wuxi Co,.Ltd)是在无锡市引进领军型海外留学归国创业人才计划(简称“530”计划)中创建的。公司以上海生物信息技术研究中心为依托,以中心主持和参与的国家重大科技专项、973、863等项目的科研成果为技术支撑,着重于科研成果的转化。
目前,公司正致力于医疗卫生信息化技术的研究、开发和服务,已研制出拥有自主知识产权的多套医疗信息化软件系统,已在全国多个医疗、科研机构广泛使用。
未来,公司将继续秉承以信息技术为引领,着重科研成果转化,全方位提供面向医疗、健康和生物医药产业的专业化服务,促进公众健康产业的发展,实现“服务大众健康、立足信息技术”。
资质与荣誉
2009年10月31日荣获中国医药生物技术协会“生物医学信息技术分会常务委员”聘书
2010年04月11日荣获中国医药生物技术协会“组织生物样本库分会会员”聘书
2010年3月荣获无锡市人民政府“2009年530计划C类项目”
2010年12月30日“众信样本库信息管理系统软件”荣获国家版权局“计算机软件著作权”
2011年01月21日“众信样本库信心管理系统软件”通过江苏省软件产品检测中心“软件产品登记检测”
2011年01月07日通过“ISO9001质量管理体系认证”
2011年05月18日通过江苏省经济和信息化委员会“软件企业认定”
2011年05月18日“众信样本库信息管理系统软件”荣获江苏省经济和信息化委员会“软件产品登记证书”
2011年06月01日“肺结节图像过滤软件系统” 荣获国家版权局“计算机软件著作权”
2011年06月01日“肺癌智能辅助诊断软件系统” 荣获国家版权局“计算机软件著作权”
2011年06月08日“肺癌影像学导航学习软件系统” 荣获国家版权局 “计算机软件著作权”
2011年06月21日“众信科研电子病例管理系统软件” 荣获国家版权局“计算机软件著作权”
2011年06月23日“众信科研电子病例管理系统软件”通过江苏省软件产品检测中心“软件产品登记检测”
2011年07月05日“众信实验室信息管理系统软件” 荣获国家版权局“计算机软件著作权”
2011年07月06日荣获无锡市科学技术局、无锡市财政局“2011年无锡市第六批科技发展计划(创新基金-创新项目)项目(项目编号CBE011107)”