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代谢组学研究服务
代谢组学通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学。
服务类别:其他生物研发总访问:1067
最后更新:2019-3-15半年访问:4
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实验平台
LC-MS
       液相色谱-质谱联用(LC-MS)可解决如下几方面的问题:不挥发性化合物分析测定;极性化合物的分析测定;热不稳定化合物的分析测定;大分子量化合物(包括蛋白、多肽、多聚物等)的分析测定。
技术服务内容
通过LC-MS分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,
利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。
实验阶段:
☆预实验阶段:对相关的实验条件进行摸索,确定最佳的实验参数;
☆正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到质谱图;
数据分析阶段:
数据预处理
差异分析
主成分分析
偏最小二乘判别分析
ROC诊断分析
预测模型构建
其他组学整合分析
 
GC-MS
        气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术,采用电子轰击(EI)方式对代谢物组进行分析。本实验平台适宜于分析小分子、易挥发、热稳定、能气化的化合物。
技术服务内容:
通过GC-MS分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。
实验阶段:
☆预实验:对相关的实验条件(制备方法、仪器参数等)进行摸索,优化实验方法;
☆正式实验:对样品进行实验操作,得到质谱图;
数据分析:
数据预处理
差异分析
主成分分析(PCA)
偏最小二乘判别分析(PLS-DA)
ROC诊断分析
预测模型构建
多组学整合分析等
 
NMR
       核磁共振(NMR)实验平台具有无损伤性,无辐射性,无偏向性等优点,已经广泛运用于代谢组学研究,我们能提供以下服务:
技术服务内容:
通过NMR分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。
实验阶段:
☆预实验阶段:对相关的实验条件(制备方法、仪器参数等)进行摸索,优化实验方法;
☆正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到核磁共振谱;
数据分析:
数据预处理
归一化处理
主成分分析
最小偏二乘判别分析
差异代谢物的挖掘
多组学整合分析等
 
 
样品要求
 
样品数量
微生物和植物每组最少6个样品,模式动物每组最少10个,临床样本每组最少30个
样品收集
血清和血浆样品500μl/例(最少不能低于200μl/例),避免反复冻融,血浆样本使用肝素钠进行外周血采集,血清样本不加肝素钠,直接装入EP管即可
尿液样品,≥1ml/例,尿液分装到离心管,每管1ml,添加一滴(约10μl)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送
细胞需要淬灭(反复冻融法、细胞超声破碎等)
组织、器官需要匀浆
 

 

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