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转录组测序概述
转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,而由于目前蛋白质实验技术的限制,转录组成为研究基因表达的主要段。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本及基因序列,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
基础服务包
1.测序数据质量控制(QC)
2.参考基因组比对服务及统计分析
3.无参考基因组的转录组拼接分析
4.新转录本基因注释
5.表达水平正则化及计算
6.表达水平统计分析(PCA,热图等)
7.样本间基因差异分析
8.样本间差异基因统计分析(火山图,热图)
增殖分析包(功能注释)
1.差异基因 Gene Ontology 显著性分析
2.差异基因代谢通路显著性分析
增殖分析包(其他分析)
1.寻找新转录本
2.融合基因预测
3.SNP位点寻找
4.可变剪切寻找及统计
增殖分析包(关联分析)
1.转录本与基因芯片关联分析
2.转录本与microRNA关联分析
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苏州帕诺米克生物医药科技有限公司(简称:诺米代谢)于 2013 年在苏州工业园区成立,是中国最早成立、规模最大的代谢组学公司之一,致力于打造代谢组学精准医学与营养全方案提供商,成为每个人的代谢管家。诺米代谢业务板块包括组学技术服务、临床质谱、组学临床产品与生物大数据平台,为全球客户提供更快更精准的代谢组学技术服务、临床产品及大数据服务。
诺米代谢由“国家千人”计划人才、金鸡湖科技领军人才领衔,创始及核心团队来自于哈佛大学、MD Anderson Cancer Center、UC Davis、加拿大 TMIC、北京大学、中科院等国内外知名高校科研院所,涵盖代谢组学、生物信息学、生物大数据、质谱、药学等领域的科学家团队。诺米代谢在苏州、南京、北京、南昌、成都、金华、东莞的实验室共运行 80 余台全型号进口质谱设备,覆盖代谢组学、蛋白质组学检测服务、临床研发与检验等领域。
基于自身完整的样品预处理平台、高分辨率质谱平台、海量代谢物库与核心匹配算法、临床大队列样本与组学大数据、独家知识产权“全靶”技术平台、及领先的云数据分析系统 BioDeep™ ,诺米代谢已为国内外 400 余家知名科研院所、400 余家三甲医院以及食品与制药企业提供全面、专业的代谢组学技术服务。服务项目囊括非靶向代谢组学、靶向代谢组学、全靶、脂质组学、蛋白组学、风味组学、空间及单细胞代谢组学,应用领域包括农业、环境、食品、营养、肿瘤、心血管疾病、代谢类疾病及肠道微生物相关的研究领域,覆盖 100 余项细分检测分析服务内容,为客户提供个性化的代谢组学科研及临床解决方案。
在质谱精准医学及组学临床方面,诺米代谢有多个创新产品研发管线,涵盖心血管疾病、脑卒中、肿瘤与肠道微生物方向的诊断、辅助诊断、早筛及用药指导应用。 基于自主国际领先的 MetaDiscovery™ 组学临床技术平台,诺米代谢在 2021 年启动和实施了中国 10 万人群前瞻性脑卒中大队列代谢组学研究计划,将持续转化多个临床诊断与早筛产品,着力于利用代谢组学技术降低中国脑卒中的发病率。 诺米代谢目前已获得元生创投、薄荷天使及沃生投资等行业知名基金的多轮投资,并取得科技领 军企业、CMA 认证企业、高新技术企业、江苏省民营科技企业、ISO-9001 质量管理体系认证、 GLP 实验室、第三方医学检验所等资质,知识产权 30 余项,临床注册产品 20 余项。诺米代谢 将在精准医学与精准营养领域持续发力,为健康中国 2030 做贡献。