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转录组深度测序分析服务
苏州帕诺米克生物科技有限公司提供454,solid, solexa等第二代转录组深度测序,生物信息分析服务
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服务类别:芯片与生物信息学总访问:1708
最后更新:2014-7-25半年访问:8
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转录组测序概述

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,而由于目前蛋白质实验技术的限制,转录组成为研究基因表达的主要段。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。

转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本及基因序列,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

     基础服务包

1.测序数据质量控制(QC)

2.参考基因组比对服务及统计分析

3.无参考基因组的转录组拼接分析

4.新转录本基因注释

5.表达水平正则化及计算

6.表达水平统计分析(PCA,热图等)

7.样本间基因差异分析

8.样本间差异基因统计分析(火山图,热图)

增殖分析包(功能注释)

1.差异基因 Gene Ontology 显著性分析

2.差异基因代谢通路显著性分析

增殖分析包(其他分析)

1.寻找新转录本

2.融合基因预测

3.SNP位点寻找

4.可变剪切寻找及统计

增殖分析包(关联分析)

1.转录本与基因芯片关联分析

2.转录本与microRNA关联分析

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