芯片介绍:
Affymetrix Genome-Wide SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物:包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化的探针;
482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片;
424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs,X,Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K 芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP;
202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针,这些区域来源的于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测;
744,000个探针平均分配到整个基因组上,用来发现求知的拷贝数变异区域。
具体应用:除了进行拷贝数研究外,还为基因分型和LOH研究提供帮助,从而能够进行:UPD检测、亲子鉴定、异常的亲代起源分析(针对UPD和缺失)、纯合性分析、血缘关系鉴定。
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