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STR SSR分析 微卫星分析 ssr多态性分析 片段分析
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最后更新:2012-6-20半年访问:4
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STR/SSR/微卫星分析

 

服务项目:

1.     STR引物开发
通过富集微卫星序列,开发出20-50条具有一定重复特征的微卫星序列,并且对序列进行多态性和特异性验证。
2.     引物筛选
选取部分代表性样本,利用普通引物进行PCR扩增,然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息
3.     样本批量扩增
用带有荧光标记(FAMHEXTMRROX等)的引物,对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR扩增平台,可以满足大量样本扩增需求。
4.     测序仪检测
带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合,用3730xl等测序仪进行毛细管电泳,并得到原始数据
5.     原始数据分析
编制panelbin等文件,使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件,并生成PDF图谱和Excel文档(包括size、基因分型等信息),分析后的电泳图谱
6.     群体遗传学分析
利用生物信息学软件(POPGENEMEGAPHYLIPARLEQUIN等)对上述数据进行进一步分析,绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。
 

送样要求:

细胞(≥106)、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(体积≥20μl,浓度≥ 50 ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。
 

提供结果:

引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。
 

成功案例:

到目前为止,我公司与上百家科研机构建立合作,进行过多个物种的引物开发、多态性分析、种系鉴定和连锁图谱构建等工作,包括人、小鼠、大鼠、兔、马、犬、牛、大熊猫、鱼、虾、麻雀、蜜蜂、蚊子、蚜虫、瓢虫、小麦、玉米、大豆、棉花、杨树、苹果、葡萄和真菌等
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