LncRNA芯片全面解决方案

在人的基因组中，只有2%碱基用于编码蛋白，而有72%的碱基是可以转录的，因此ncRNA的存在有很大的空间。然而这些不编码蛋白的RNA（ncRNA）有什么作用呢？近些年，研究者们主要将目光聚集在短的ncRNA（miRNA）上，已经发现了数千个miRNA，其主要功能是调节基因的表达。但是我们不能忽视更长一些的也具有重要功能的longncRNA。Long ncRNA (lncRNA) 是一类转录本长度超过200nt的RNA，它们本身并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上调控基因的表达水平，已知作用则包括基因沉默、基因印记和反义抑制。随着近年来lncRNA不断被发现，人们开始关注LncRNA在各种生物学过程以及疾病中所起到的作用。通过lncRNA芯片，研究人员能够快速高通量的获得与特定生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化。

一、技术路线和方法：

二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01：原始数据预处理与均一化
Part02：差异lncRNA筛选
Part03：聚类分析（层次聚类）
Part04：差异lncRNA靶基因预测
Part05：靶基因GO分类
Part06：靶基因Pathway分析
2.2 高级数据分析
Part08：差异lncRNA转录因子结合位点分析
Part09：差异lncRNA与靶基因调控网络
Part10：转录因子、lncRNA、靶基因互作网络
Part11：目标基因反向预测lncRNA
Part12：lncRNA引物设计

三、芯片平台
 

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公司介绍:上海百趣生物医学科技有限公司（简称百趣生物）成立于2013年4月，是一家专业提供生命科学前沿研究技术应用、咨询及开发的高新技术企业。百趣生物专注于创新质谱技术在生命科学研究与医学健康两大领域的应用，尤其在生命科学研究领域，公司在国内市场获得了优秀的口碑。自成立以来，百趣生物相继被认定为国家高新技术企业、高新技术成果转化项目、上海市科技型中小企业技术创新资金资助项目，百趣实验室相继取得了病原微生物实验室BSL-2备案、CMA认证。公司目前已经建立并完善的代谢组学平台，包括非靶标代谢组、高通量靶标代谢组、常规靶标代谢组、脂质组学、代谢流检测，同时建立了蛋白质组学平台，提供靶向及非靶向蛋白组学、修饰蛋白质组学、多肽组学等业务。

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