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基因芯片数据分析服务-生物信息学分析

基因芯片数据分析服务-生物信息学分析


MicroArray bioinformaticals Analysis
提供丰富的芯片分析科研图谱,完整的生物信息学分析,充分挖掘芯片扫描(或测序)结果的生物学信息,使用同一原始数据,却可获得多个层次的归纳结果,是科研文章发表和深入科研实验研究的最佳选择。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:3176
最后更新:2011-12-23半年访问:4
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生物信息学分析    

 

一.   基因芯片结果分析

 

        1.   差异表达基因分析

             基因芯片数据标准化、上调基因/下调基因、t-检验(P值)、方差分析(F-检验)、基因聚类(Cluster)、热图(Heatmap)、多样本分子标志物聚类(如肿瘤分子标志物聚类分析)。可分析mRNA表达谱、miRNA表达谱和甲基化基因芯片数据表达谱差异。(结果形式:分析表格、红绿热图、Cluster分类树)

                

        2.  基因数据相关性分析

             分析内容:基因芯片数据质量控制和分析(结果形式:相关性分析结果表格)

 

        3.  GO分析(Gene Ontology)

           分析内容:包含基因芯片内所有差异表达基因的GO功能注释(结果形式:注释表格)和GO功能富集分析图(结果形式:热图Heatmap和聚类Cluster)。

 

       4.  Pathway分析

            分析内容:所有差异基因相关的KEGG代谢通路、BioCarta或细胞信号转导通路(Signal Pathway)(结果形式:pathway表格)、Pathway富集分析图(结果形式:热图Heatmap/聚类Cluster ,富集参数表格)

 

      5.  miRNA靶点基因预测和新miRNA预测

           分析内容:预测差异表达miRNA的靶点基因、KEGG pathway (结果形式:注释表格)  

 

       6.   甲基化位点分析

            分析内容:甲基化位点分布,高甲基化/低甲基化位点分布(结果形式:饼图或柱图)

        7.  SNP位点分析

            分析内容:分析某一细胞信号转导通路机制或某一疾病相关的主要SNP位点。(结果形式:分析表格)

   

二.   基因组测序序列分析

        1.  全基因组序列功能注释

         分析内容:预测基因组编码区ORF(CDS)、tRNA、rRNA的起始位点和终止位点和长度,并注释基因功能。(结果形式:分析表格)

            

         2.   全基因组序列拼接

         分析内容: 将短的测序序列拼接成一个完整的基因组fasta序列文件。(结果形式:fasta序列文件)

 

          3.  全基因序列功能聚类

           分析内容: 将基因组所有基因序列进行功能分类 (结果形式: 饼图,功能分类层次表)

                 

 

          4. 系统发育树/物种进化树/分子进化树构建

              分析内容:通过ClustalW进行多基因组序列比对,构建不同物种之间的进化树。(结果形式:进化树图,模式可选)

                       

 

          5.  不同基因组序列KEGG代谢通路分析

               分析内容:预测基因组基因的KEGG代谢途径。(结果形式:KEGG图谱)

                        

         6.  全基因组CDS编码区分布图(circos圈图)

              分析内容:绘制全基因组基因分布、tRNA分布和rRNA分布图。(结果形式:circos圈图)

                        

         7.  多基因组GO功能差异分析

              分析内容:绘制不同物种的基因组GO功能差异图。(结果形式:柱图)

 

        8.  共线性分析

 

        9.  SNP位点连锁不平衡分析

            咨询客服QQ:1679376072

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