该芯片可一次杂交12个样本,以提供高通量的,价格低廉的,以及不需要特殊设备的样本检测。该芯片旨在使检测更加灵活以适用不同实验的要求。
※小鼠MouseWG-6 v2.0全基因组表达谱微珠芯片
每张芯片可同时检测6个样本,每样本分析超过45200个转录本,基因信息来自于NCBI RefSeq database (Build 36, Release 22)、RIKEN FANTOM2 database、RefSeq Release 5(Build 33.1)以及MEEBO(Mouse Exonic Evidence Based Oligonucleotide)
※小鼠MouseRef-8 v2.0全基因组表达谱微珠芯片
每张芯片可同时检测8个样本,每样本分析超过25600个转录本,基因信息来自于NCBI RefSeq database(Build 36, Release 22)
※大鼠RatRef-12全基因组表达谱微珠芯片
每张芯片可同时检测12个样本,每样本分析超过22000个转录本,基因信息来自于NCBI RefSeq database(Release 16)
※Illumina定制芯片
根据用户要研究的基因列表,进行生物信息学分析及实验验证挑选动力学反应最好的探针,用BeadArrayTM技术制成可同时检测16个样本的Sentrix Bead Chip芯片或同时检测96个样本的Sentrix Array Matrix芯片,每样本可分析1400个人、小鼠、大鼠基因或700个其他物种基因
为了提供更多有生物学意义的结果,该芯片按照最新的数据库设计了覆盖全基因组范围的检测探针,主要包括已知基因,候选基因和不同的剪切体。
每张芯片上包含了31000多个来自最新的NCBI数据库(NCBI) RefSeq Release 38 (November 7, 2009)的基因信息并为这些基因设计了超过47000个探针。
——一次检测12样本使得大规模的表达谱可以以更快的速度和更低廉的价格进行
——在芯片采用直接杂交法进行检测,并用iScan, BeadArray Reader或HiScanSQ进行扫描
——样品标记最少只需50ng总RNA即可完成
探针信息:
HumanHT-12 v4
RefSeq content (Release 38)
NM(成熟的mRNA) 28688
XM(转录序列) 11121
NR(不编码的RNA,假基因或其他) 1752
XR(不编码的转录序列) 2029
其他来源
Unigene数据库 3461
总计 47231