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提供甲基化测序的数据分析服务
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敏芯科技为您提供如下分析服务
一、项目目标
MeDIP-seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing）采用甲基化DNA免疫共沉淀技术，通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段，然后进行高通量测序。分析内容：寻找基因组上的甲基化区域，从而比较不同细胞、组织、或疾病样本间的DNA甲基化差异。
二、项目方案
2.1.测序数据预处理
我们对测序数据进行质量控制和预处理。去除接头污染，并去除可信度低的序列。对符合质量要求的数据进行归并与整理。
2.2. 序列比对与序列富集区域（peak）的预测
我们利用比对软件将序列与参考基因组序列进行比对。利用序列富集区域（peak）的预测算法预测peak位置。
2.3.序列富集区域（peak）与基因注释
我们从public数据库获得最新的基因坐标数据，与我们预测的peak位置进行比较。将peak区分为不同的类别，统计结果示例：
2.4. DMR（Differentially methylated region）差异甲基化区域筛选
对于分组的MeDIP-seq数据，我们通过统计学方法，如Fisher's exact test，筛选在不同组间存在显著差异的peak。同时我们还将提供peak相关的基因注释内容。
2.5. 其他可选分析
甲基化结果可以与表达谱数据进行关联整合分析。另外，甲基化也可以做转录可变剪切等方面的深入挖掘。
＊ 所有版权及解释权归上海敏芯信息科技有限公司所有；根据客户的要求可以继续进行其他的深入分析，如有问题请联系021-31523052
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