对于定制芯片，由于基因数目相对于基因组芯片来说较少，所以可以在芯片原始数据z-score归一化后，取所有基因作芯片方向的聚类分析。对于基因总数<2000的芯片，层次聚类等聚类算法可以有效地进行。 这样可以直接将多张芯片归入不同的组，即亚型。该实例的32张芯片中，28张芯片为糖尿病II型的，4张为糖尿病I型的。
计算每个基因的信息熵，信息熵越大表明分子在各张芯片中的表达是一致的。而低信息熵基因则可能是亚型特异的（只在某种亚型中特异表达）。结合基因筛选算法，我们可以将这种基因查找出来作为该种亚型的签名基因。我们找到3个II型糖尿病特异基因。
bio-equip.com
公司介绍
先进通量公司的总部位于加利福尼亚州美丽的旧金山湾畔，由一些经验丰富的生物技术方面的专家创立。先进通量公司向全球提供高质量的基因芯片技术服务，主要面对如下客户提供服务：
1 生物技术公司
2 制药公司
3 科研机构
为了满足中国市场对于高质量芯片服务的需求，先进通量公司在中国设立分支机构，为中国客户提供高质量的服务和完善的芯片解决方案。在2006年，先进通量公司在中国获得的第一个客户——复旦大学。复旦大学之所以选择先进通量公司是基于对其美国核心实验室所拥有的专业知识和经验、有效的组织管理和良好的服务质量的了解。而先进通量公司则凭借具有竞争力的价格向复旦大学提供优质高效的高通量筛选服务。
先进通量公司意识到全球市场上迅速增长的对于基因表达，基因分型以及序列分析的基因芯片技术服务的需求。公司也正凭借对于基因高通量的筛选，积极参与推进“个性化用药”运动。先进通量公司在全球范围内提供如下的服务:
1 实验设计咨询
2 生物样品的制备
3 样品的检测和分析
4 数据结果分析服务
先进通量公司致力于建立和完善基因芯片微阵列分析、数据处理和数据管理过程中的质量标准和技术规范。公司已建立起一整套严格的标准化操作流程（SOP’s）技术规范来减少实验误差。所建立的标准化操作流程符合21CFR part 58 (GLP)和21CFR part 11(Electronic Records and Signatures)。
先进通量公司位于中国的办事处设立在中国科学院生命科学园区内。目前，先进通量公司已经同复旦大学联合建立了实验室——复旦先进通量研究中心。同时，公司也正在和国家药监局（SDA）共商合作事宜。先进通量公司正计划在中国发展一个基于基因芯片检测结果的基因表达数据库，并期望这个数据库有利于加速药物的开发和检测手段的发展。
专家顾问
金 力
科学顾问
“长江学者”讲座教授，复旦大学特聘教授, 博士生导师。复旦大学生命科学学院院长、美国辛辛那提大学医学院环境健康系基因组信息中心终身教授，北美华人遗传学会会长、中科院——马普计算生物学伙伴研究所所长、上海摩尔根——谈家桢国际生命科学研究中心教授，国家人类基因组南方研究中心副主任、 国家“973”项目共同首席科学家。
卢大儒
科学顾问
复旦大学生命科学学院教授、博士生导师。同时担任中国第六届全国科协委员、中国遗传学会理事、中国民族学会理事、复旦大学生命学学院学术委员会委员，实验生物学报——国外医学遗传学分册和突变癌变畸变杂志编委。
陈帆青
科学顾问
美国劳伦斯·伯克利国家实验室科学家、主要成员。
