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mRNA测序使用oligo d(T)富集方法结合高通量测序研究mRNA的表达和调控,是几乎所有研究的...
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m6A甲基化修饰是指腺嘌呤的6号碳原子连接的氨基基团中的一个氢被甲基基团所取代。
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染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)广泛存...
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circRNA是通过外显子反式剪接(back splicing)形成的一类共价闭合环状RNA,广泛存...
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ChIP-seq使用抗体富集的方法在基因组范围内检测多种蛋白(例如转录因子CTCF)和其他染色质相关...
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LncRNA是一类长度大于200 nt的非编码RNA,通常认为它们并不编码蛋白质,而是以RNA的形式...
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GEO数据库(或者ENA数据库)中包含大量芯片、测序原始数据。这些数据一般都是可以免费下载使用的,充...
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miRNA是一类长约22 nt的非编码小RNA。miRNA通过碱基互补配对结合到靶mRNAs 3’U...
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TCGA,The Cancer Genome Atlas Program,癌症基因组图谱计划,该数据...
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肿瘤组织中并不是100%的细胞都是肿瘤细胞,还含有基质细胞,成纤维细胞,免疫细胞等,这些细胞构成了肿...
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随着高通量测序的发展,越来越多的物种被测序。无参转录组是指在没有参考基因组的情况下,对真核生物的转录...
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CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),是...
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piRNA(PIWI-interacting RNA),是一类长约25-33 nt的非编码小RNA,...
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ATAC-seq,即利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术,是染色质构象研究的主流方法。
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