邀请函：百蓁邀您参展2024美国ASMS PEAKS用户会

在Bioinformatics Solutions Inc. (BSI)，我们秉承的使命是通过深度学习软件解决方案和世界领先的质谱技术服务来推进蛋白质组学和糖蛋白组学的研究。在今年的ASMS上，我们很高兴为大家介绍最新版本的PEAKS^®️ Studio和PEAKS^®️ Online，并介绍我们实验服务的新项目，如DeepImmu^®️免疫肽组学发现服务和PEAKS^®️ AB多克隆抗体测序服务等。您可以通过邮件（peaks@bioinfor.com）与PEAKS团队成员预约会议，或直接到#302展位交流。

PEAKS 用户会
时间: 6月2日，星期日，12:00 pm – 4:30 pm PDT
地点：Sheraton Park Hotel at the Anaheim Resort, 1855 S Harbor Blvd, Anaheim, CA 92802, United States
PEAKS用户会注册链接：https://www.bioinfor.com/peaks-users-meeting-2024/

BSI很荣幸地邀请到了Andy Qi Ph.D. (NIH)，Darshit Shah MSc.（美国再生元制药公司)，Richard Kay Ph.D. (剑桥大学)和John Muchena Ph.D. (雅培公司)来分享他们如何使用PEAKS^®️软件完成实验研究。在用户会期间，PEAKS团队还将展示PEAKS^®️ 12的最新功能以及我们的实验室提供的最新服务项目。演讲结束后，PEAKS将在露台举办交流活动，为大家提供精美食物和饮料！

PEAKS 展会信息

• 展位号： #302

• 时间：
  June 2: 7:45 pm – 9:00 pm
  June 3–5: 9:00 am – 5:00 pm
  June 6: 9:00 am – 2:30 pm

• 展会地点：Anaheim Convention Center, 800 W Katella Ave, Anaheim, CA 92802, United States

软件亮点
在今年ASMS上，大家将了解到我们如何在PEAKS^®️ Studio和PEAKS^®️ Online中推进深度学习的应用。在PEAKS^®️ 12中，我们整合了人工智能算法来提升多肽从头测序，PEAKS DB, PEAKS DIA和用于免疫肽组学的DeepNovo ^®️ Peptidome。

1. 在新版本的PEAKS^®️软件中，用户将体验到最准确和最快的多肽从头测序。多年来，PEAKS一直被业内看作是自动多肽从头测序的黄金标准，随着GPU加持的“DeepNovo”推出，PEAKS中的从头测序也达到了有史以来的最高水平。
2. 深度学习已应用于我们的DIA分析工作流，包括谱图库搜索、直接数据库搜索和从头测序。在新版本中，用户可以体验到更快的DIA数据分析，更高的灵敏度和准确性，以及更好的短梯度数据支持。
3. DeepNovo^®️ Peptidome workflow支持DDA和DIA数据的免疫肽组分析。新版中，我们整合了最先进的DeepNovo算法，实现了更快的速度，提供更全面的肽段信息，包括翻译后修饰、序列变异和新生肽段。
4. PEAKS DB search提供了一种独特的de novo辅助的数据库搜索方法，以提高灵敏度和准确性。用户可以选择通过深度学习提升MS2评分，并将鉴定数量提高约10%。

我们的免疫肽组学服务包括细胞裂解、组织和血浆样品处理、MHC多肽纯化、LC-MS/MS数据采集、多肽鉴定、序列MOTIF分析、结合亲和力和免疫原性预测。此外，还包括质控测试，以确保结果的准确性。我们先进的软件算法和PEAKS DeepNovo Peptidome工作流程为免疫肽的定性和定量提供准确、灵敏和可重复的结果。

TP 566 
Title：An AI-driven, proteogenomics-based and complete workflow for novel neoantigen discovery
Authors: Qing Zhang [1], Kyle Hoffman [1], Sahar Rabinoviz [1], Peng Chao [2], Haibo Bian [1], Wenting Li [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China

ThP 058 
Title：A Bayesian model for estimating the posterior error probability and the false discovery rate of de novo peptide sequencing
Authors: Hieu Tran [1], Rui Qiao [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

WP 047 
Title：Revolutionizing Proteomics: Ultra-Fast, High-Accuracy Peptide Sequencing with Enhanced GraphNovo Algorithm
Authors: Zeping Mao [1], Lei Xin[1], Shengying Pan [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

WP 704 
Title：Combining Top-Down and Bottom-Up Mass Spectrometry Paves the Way for High Throughput Polyclonal Antibody Sequencing
Authors: Lei Xin [1], Peng Chao [2], Jun Ma [2], Peng Chao [1], Shuyang Zhang [1], Zihao Wang [1], Wenting Li [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China

MP 451 
Title：Confident identification of proteome-wide low-level mutations using PEAKS 11.5
Authors: Kyle Hoffman [1], Julie Genereaux [2], Lei Xin [1], Zia Rahman [1], Christopher J Brandl [2], Patrick O’Donoghue [2], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Wester University, London, ON
 

-扫码关注-
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www.deepproteomics.cn（CN）

作为生物信息学的领军企业，BSI专注于蛋白质组学和生物药领域，通过机器学习和先进算法提供世界领先的质谱数据分析软件和蛋白质组学服务解决方案，以推进生物学研究和药物发现。我们通过基于AI的计算方案，为您提供对蛋白质组学、基因组学和医学的卓越洞见。旗下著名的PEAKS^®️系列软件在全世界拥有数千家学术和工业用户，包括：PEAKS^®️ Studio，PEAKS^®️ Online，PEAKS^®️ GlycanFinder, PEAKS^®️ AB及抗体综合表征服务等。

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