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410 次 基因沙漠：调控Shox2基因多效性表达与胚胎发育的关键区域 2024-11-20
文章题目：A gene desert required for regulatory control of pleiotropic Shox2 expression and embryonic survival发表时间：2024.10.10发表平台：Nature Communications影响因子：IF 14.7 Q
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479 次 利用染色质免疫共沉淀测序技术ChIP-seq等揭示头颈鳞癌免疫逃逸机制 2024-10-9
免疫逃逸是癌症进展的关键里程碑，是肿瘤免疫治疗的理论基础。头颈部鳞状细胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常见的恶性肿瘤之一，传统治疗选择包括手术切除、放
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826 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1轴在疾病进展中的表观调控作用 2024-8-27
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一种慢性肝脏疾病，其特征是肝脏中脂肪积累、炎症和纤维化。干扰
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617 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq联合检测揭示花发育器官转录因子调控机制 2024-6-28
技术简介MADS转录因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是调控拟南芥花发育分化的重要DNA结合蛋白。在雌蕊发育阶段，SEP3和AG形成异源四聚体，通过识别CArG-box序列来调控基因的表达。
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762 次 ChIP-seq等在揭示m6A修饰以促进卵巢癌发展研究中的应用 2024-2-29
卵巢癌（Ovarian cancer，OC）是影响女性生殖系统的三种常见恶性肿瘤之一。转录因子Forkhead box蛋白O1（FoxO1），又称forkhead横纹肌肉瘤（rhabdomyosarcoma）转录因子，属于Forkhead box O（F
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588 次 ChIP-seq等揭示人畜共患寄生虫弓形虫的蛋白质乳酸化和代谢调控机制 2024-1-29
弓形虫（Toxoplasma gondii）是弓形虫病（toxoplasmosis）广泛传播的寄生虫病的病原体之一，但其生物学特性仍然知之甚少。乳酸（Lactate）作为葡萄糖代谢的产物，不仅在包括弓形虫在内的多种生物
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574 次 文献解读：WWOX基因通过上调Myc促进骨肉瘤发生发展的表观调控机制 2024-1-10
骨肉瘤（Osteosarcoma, OS）是一种高侵袭性骨肿瘤，主要影响儿童和青少年。这种恶性肿瘤与不良临床结果相关，尤其是肺转移。由于其罕见性和生物学异质性，对其分子基础研究有限，阻碍了有效疗法
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518 次 ChIP-seq等揭示SETD2介导H3K36me3调控结直肠癌进展的表观遗传机制 2023-12-5
结直肠癌(Colorectal cancer，CRC)是一种复杂的多阶段疾病，由基因突变和表观遗传改变相互作用引起。组蛋白H3K36三甲基转移酶SET结构域2 (SETD2)是一种表观遗传信号分子，在结直肠癌中突变率为5
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511 次 ChIP-seq揭示BRWD3调控KDM5活性以维持H3K4甲基化水平的表观机制应用 2023-10-31
组蛋白修饰对调控染色质结构和基因表达至关重要，组蛋白修饰失调可能导致疾病状态和癌症。染色质结合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素连接酶复合
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552 次 ChIP-seq等在揭示Runx2通过转录调控表达激活肝星状细胞中的应用 2023-8-31
肌成纤维细胞（myofibroblasts）主要由肝脏中活化的肝星状细胞(hepatic stellate cells HSC)组成，在肝纤维化进展中发挥着核心作用。由于肌成纤维细胞主要负责细胞外基质蛋白的合成、沉积和重塑
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520 次 ChIP-seq等在揭示NRF1促进原始生殖细胞的发育、增殖和存活中的应用 2023-8-14
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。原始生殖细胞（Primordial germ cell，PGC）是生殖细胞前体，可以产生卵母细胞和精子，确保生命延续。尽管PGC特化（PGC specif
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495 次 ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制 2023-7-18
蜜蜂是一种真社会性昆虫，是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物，其分工主要基于级型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，尽管基因组相同，但蜂王和工蜂具有不同的形态、生
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829 次 染色质免疫共沉淀测序ChIP-seq研究成果汇总及DNA-蛋白质互作研究思路 2023-6-26
在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活
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705 次 ChIP-seq等揭示METTL14调控哺乳动物二价结构域的表观遗传机制 2023-6-20
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。组蛋白及其翻译后修饰在调控基因表达和其他染色质模板化过程中起着重要作用。组蛋白H3赖氨酸4三甲基化（H3K4me3）和组蛋白H3K2
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609 次 细菌ChIP-seq测序分析在抗生素合成机制研究新进展中的应用 2023-6-12
2023年06月07日，华东理工大学生物工程学院和生物反应器工程国家重点实验室叶邦策教授和尤迪副教授为共同通讯作者、博士生符瑜为第一作者以“A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP
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853 次 全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点 2023-5-30
细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对T
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826 次 ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制 2023-4-24
在拟南芥中，热休克转录因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素，这种调控机制怎么形成的呢？2018年，
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757 次 高通量测序后的下游实验验证方法之ChIP-seq介绍 2023-3-28
此前，我们分享了染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq）的数据挖掘思路，进而筛选出TF结合/组蛋白修饰的目标区域和候选靶基因。做完ChIP-seq测序后，如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证，
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1110 次 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq）的数据挖掘思路 2023-3-27
CHIP-seq研究的数据挖掘思路主要分为3步：1. 整体把握CHIP-seq图谱特征：peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分
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247 次 DAP-seq技术助力胡杨耐盐机制的研究 2020-4-21
2019年9月，北京林业大学和蓝景科信合作，在植物学主流学术期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），发表了题为“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase