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239 次 时空组学研究进展（二)：单细胞RNA测序数据的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影响因子：8.0scRNA-seq 的原始数据格式和目前大多数scRNA-seq 分析过程都基于 FASTQ 文件（或压缩格式 fq.gz）。Illumina 平台测序数据默认生成 BCL 格式文件
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319 次 时空组学研究进展（一）：单细胞RNA测序的流程与技术 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影响因子：8.0单细胞测序概述单细胞测序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一种开创性的单细胞测序技术，现在已得到广泛普及，并涵盖了多种方法。尽
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590 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸铝分子调控新机制 2024-10-23
2024年10月2日，云南农业大学园林园艺学院营养逆境与品质改良杨建立/范伟团队在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在线发表题为“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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587 次 Sfrp1抑制肺成纤维细胞向损伤诱导的肌成纤维细胞转变期间的侵袭 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影响因子：16.6主要技术：scRNA-seq；空间转录组；成纤维细胞导语组织纤维化是大多数主要慢性疾病中最大的未解决的临床问题之一，产生细胞外基质（ECM）的肌
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681 次 植物组学时代的DNA甲基化研究在群体表观遗传学中的应用 2024-8-20
DNA甲基化在许多生物过程中发挥着重要作用。得益于数十年来对DNA甲基化突变体的研究，如今对DNA甲基化的建立和维持机制有了很好的理解，尤其在拟南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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742 次 空间转录组学在揭示独特和保守的肿瘤核心和边缘结构中的应用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影响因子：16.6主要技术：ScRNA-seq、ST导语肿瘤微环境的空间组织对生物学和治疗反应有着深远的影响。对hpv阴性口腔鳞状细胞癌(OSCC)进行了单细胞和空间转录组学分析
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742 次 DAP-seq与RNA-seq联合分析助力揭示AvERF73参与调控猕猴桃的耐涝性 2024-4-24
涝害（Waterlogging）是长期阴雨或暴雨后，由于地表积水，地面径流不能及时排除，积水深度过大，时间过长，造成作物根部氧气不足，并产生乙醇等有毒有害物质，从而影响作物生长，甚至造成作物死
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601 次 RNA-seq技术探究从牛膝中分离得到的果胶多糖被人体肠道拟杆菌代谢 2023-9-25
期刊：Int J Biol Macromol影响因子：8.2伯豪技术服务：RNA-seq导语牛膝是治疗骨质疏松症的著名中药。多糖是形成肠道微生物群的主要因素，是双棱草的主要成分。然而，双歧杆菌多糖对人体肠道菌群
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619 次 scRNA-seq在弥漫性大B细胞淋巴瘤的单细胞转录组图谱绘制中的应用 2023-8-2
期刊：Cell Reports影响因子：8.8导语弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是最常见但侵袭性最强的B细胞淋巴瘤之一，大约40%的患者仍然无法治愈。本研究使用单细胞测序（scRNA-seq）技术成功绘制了弥漫
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859 次 RNA-seq等技术应用与探究结直肠癌远端转移起源于残留的EMP1+细胞 2023-6-16
期刊：Nature影响因子：69.504导语大约30-40%的接受了原发性肿瘤根治性切除术的结直肠癌（colorectal cancer CRC）患者将在几年后发生转移。重要脏器的转移及术后复发仍是主要的致死原因。然而，
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689 次 全基因组DNA甲基化和小RNA分析揭示甘蓝型油菜种子的基因组不对称性 2023-6-9
多倍体是被子植物基因组进化中的一种持续现象，有助于现存开花植物的多样性。甘蓝型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品种之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica ol
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506 次 小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激 2023-6-6
中药小檗碱（Berberine，BBR，化学式C20H18NO4）是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱，包括小檗（Berberis aristata）和黄连（Coptis chinensis）。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细
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851 次 全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点 2023-5-30
细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对T
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666 次 MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作用 2023-5-26
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。结直肠癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常见的癌症之一，转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断（Immune che
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762 次 mRNA-seq转录组测序应用于原位自组装类器官用于软骨组织再生 2023-5-24
期刊：Bioact Mater影响因子：14.593导语由于在诱导间充质干细胞(MSCs)向软骨和骨室的空间、定向和可控分化方面存在困难，分级骨软骨单位的再生具有挑战性。新兴的类器官技术为骨软骨再生提供了
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582 次 全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 2023-5-23
听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关，是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的
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884 次 DNA甲基化和转录组分析揭示野生草莓干旱胁迫分子调控机制 2023-5-12
干旱胁迫是对农业生产产生不利影响的关键环境因素。为此，植物发展出各种响应机制（干旱逃逸、避免、耐受和回复），以通过进化增强抗旱性，这些适应机制从分子到植物水平都所不同。黄毛草莓（Fr
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629 次 基于动态DNA甲基化图谱观察脂肪形成过程中的细胞谱系特异性发育 2023-3-29
2016年10月，温州医科大学检验医学院（生命科学学院）丁春明研究员及团队在《Molecular Metabolism》杂志发表题为“Dynamic DNA methylation landscape defines brown and white cell spec
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1644 次 植物逆境胁迫响应的表观遗传调控机制介绍（抗干旱+耐高温+抗干耐盐） 2023-2-28
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期我们聚焦植物逆境胁迫响应的表观遗传调控机制。DNA甲基化在对环境刺激的反应中起着至关重要的作用。植物DNA甲基化会随着各
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839 次 单细胞转录组测序在揭示高脂喂养小鼠胰岛细胞亚群的特征中的应用 2023-2-7
胰岛是一种包含多类细胞的精密微小器官，其中α、β和δ等内分泌细胞参与机体血糖稳态的调控。大量研究表明，肥胖诱导的2型糖尿病早期即出现胰岛素抵抗伴随胰岛功能障碍，胰岛&al