ToolBox在差异分析中火山图上标记基因并局部放大的方法

在差异分析中，我们有时会着重关注上调/下调差异基因，并会在火山图上标注感兴趣的基因。借助SBC ToolBox在线绘图工具，我们可以在火山图上标注基因，并将指定区域放大展示。

火山图

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火山图横轴为log2FC，纵轴为显著性p-value，红色点代表显著上调基因，蓝色点代表显著下调基因。

首先上传画图数据，格式如下（需要有表头）：

数据上传完毕后，点击“提交分析”，即可在“输出结果展示”界面看到默认参数下生成的图片。在“参数调整设置”中可以对图片进行自定义调整，例如点的颜色/大小/透明度、差异基因筛选标准、坐标轴名称、主题、界限颜色/宽度/类型。

将主题改为Bw，背景增加灰色网格线。修改界限类型为虚线，并将点放大，得到以下图片：

进行基因标注时，将一列GeneSymbol复制到“基因标记”输入框，即可完成标注：

局部放大火山图

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https://www4.shbiochip.com/V2023/SCTP/zmIn/

如果关注上调/下调差异基因，我们可以将该区域局部放大。例如要将上调基因区域放大，在“参数调整设置”中修改以下参数：

生成结果如下，右边的上调基因区域被放大，图中仍可进行基因标注：

以上就是使用在线工具得到的绘图结果。SBC ToolBox共有七十余个绘图工具，目前还在持续更新中，注册后即可免费绘制各种自定义图片，快来看看吧。

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