10x Genomics Visium空间分析实验规划资源必备指南
空间转录组学是一种开创性的分子分析方法，使科学家能够测定组织样本中的基因活性，并绘制该活性发生的位置。10x Visium空间基因表达解决方案可在整个福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）或新鲜冷冻组织的形态学背景下定位全转录组，从空间上解析基因表达，从而获得疾病病理和临床转化研究的新见解。
Visium空间基因表达玻片的核心是带有空间条形码、与mRNA结合的寡核苷酸。如需捕获新鲜冷冻组织的基因表达信息，先处理样品切片从组织中释放出mRNA，使其与组织相应位置附近的捕获寡核苷酸相结合。在组织原位进行逆转录，生成带有空间条形码并保留空间信息的cDNA文库。如需捕获福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的基因表达信息，先对组织进行透化处理，使其释放出连接的探针对，与玻片上的捕获探针相结合。延伸探针对，以生成带有空间条形码并保留空间信息的文库。带有条形码的文库可映射回捕获区的特定数据点。随后将这种基因表达数据与组织切片的高分辨率显微镜图像相叠加，从而能够以空间分辨的方式观察组织形态背景下任一条mRNA或多条mRNA组合的表达。
Visium空间基因表达结合免疫荧光的流程能够轻松融入标准的组织切片和IF染色方法中，且使用现有的抗体。在同一张组织切片上实现蛋白质、总mRNA和组织学分析，最大限度地使用宝贵样本。将全转录组空间分析与免疫荧光蛋白检测相结合，可更全面地捕获组织切片上的生物学图像，从而增进对人类健康和疾病的了解。
将Visium空间基因表达解决方案与易用且广泛的靶向基因组合相结合，观察基因表达的空间模式，全面靶向相关基因，聚焦最关键的基因，能助力您洞悉研究中最重要的生物学本质。用预先设计好的癌症、免疫学、神经科学和基因标签组合结合新鲜冷冻组织的Visium空间基因表达检测，来分析一组特定的转录本。您可以在我们全面的、预先设计的基因组合中选择一种，并自行添加多达200个定制基因，在测序前富集您的Visium空间文库。
Visium空间分析实验规划资源必备指南可作为路线图，帮助您设计Visium空间基因表达实验，优化实验参数，并确定适当的计算/分析工具来分析空间基因表达数据。
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