10x Genomics Visium FFPE空间基因表达解决方案介绍

        FFPE (Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded)指的是用福尔马林固定、石蜡包埋样本的方法。由于可以在常温状态下保存很久，FFPE样本是目前医学领域常见的生物材料。但FFPE样本一般存在严重的RNA降解，福尔马林的固定容易使组织中的核酸发生不同程度的降解和分子间的交联，石蜡的高温渗入过程又进一步加速了核酸的降解，保存的时间及环境对样品中核酸的完整性也有很大影响，这对于研究者们进行科学发现来说无疑是很大的挑战。
     
       10x Genomics的Visium空间基因表达解决方案是一种结合组织学和表达谱信息来定位和量化组织中基因表达的方法。针对FFPE样本，采用靶向基因的探针对的RNA模板连接，对人和小鼠FFPE组织切片上的全转录组进行高度特异且灵敏的检测，可在形态背景和空间组织中发现新的细胞类型和生物标志物，揭示肿瘤、神经科学等领域复杂的组织异质性。



        在准备构建文库时，对捕获区域的FFPE组织进行透化处理，以释放出连接的探针对，使其与玻片上的捕获探针杂交，从而实现基因表达信息的捕获，延长探针对以掺入空间条形码，并制备测序文库。


       
       通过10x Genomics提供的开源软件Space Ranger来处理数据，可将空间基因表达信息与组织图像相叠加，并通过Loupe Browser可视化软件来实现交互性地探索结果，进而分析和了解基因与蛋白表达的异质性。

• 针对RNA降解的FFPE样本，可同时获取空间位置和基因表达信息；

• 无需购买10x Genomics仪器，节省费用；

• 无需预先选择ROI（region of interest），可对整张组织切片进行无分析；

• 分辨率高，每个spot可涵盖1-10个细胞

• 提供从样本制备到数据分析的完整解决方案

       10x Genomics是一家生命科学技术公司，致力于对生物学进行研究，理解和掌握从而促进人类健康。该公司的综合解决方案包括用于分析生物系统的仪器、试剂耗材和软件，其所能提供的分辨率和规模与生物学的复杂性相匹配。10x Genomics的产品已被全球的研究人员所采用，其中包括全球100强研究机构和全球20强制药公司，并被2800多篇有关肿瘤、免疫学和神经科学等发现的研究论文引用。公司的专利组合包括超过1100项已发布的专利和专利申请。       
       北京怡美通德科技发展有限公司是一家专业代理生物技术产品的分销公司，在NGS及相关技术领域具有近20年为广大科研客户提供专业产品和服务的经验。目前为10x Genomics北区的官方授权代理商，负责10x Genomics产品在相关区域内的销售、市场推广以及售前售后技术服务等，为客户提供10x Genomics单细胞和空间多组学测序的Demo实验、平台建设、技术咨询、试剂周转供货、实验操作和生物信息学培训、仪器保修和售后问题解决等专业服务。欢迎通过如下方式联系我们，电话: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。