STR鉴定报告看不懂，希尔博士来解忧
今天就来分享STR的鉴定报告如何解读？
1.STR检测流程
首先了解下STR检测流程，先提取细胞DNA, 然后进行PCR扩增及测序，最后进行结果分析。详细检测流程请看下图：
▲图1 STR检测流程
* Dr.Cell 采用的细胞STR鉴定方法完全符合美国国家标准局（NIST）颁布的细胞鉴定标准-ANSI/ATCC ASN-0002-2011, 并且在中国CMA认证与司法鉴定许可的实验室进行检测。
完整的细胞STR检测报告请查阅（STR Report-Sample），报告上会列出受检细胞系STR基因分型结果附表（图2），表格中将列出所有实际检测位点信息。第2列“Sample”为样本检测得到的STR位点信息, 该结果是根据实际PCR扩增后检测到的片段长度得到的数据信息。第3列为ATCC、DSMZ等数据库中标准细胞STR位点信息。数据库中常规提供9个位点信息，即 Amelogenin, CSF1PO, D13S317, D16S539, D5S818, D7S820, THO1, TPOX, vWA。
▲图2 STR基因分型结果
在报告中会给出受检细胞系的STR检测结果峰图（图3），该峰图是实际PCR扩增后检测到的片段长度和分型信息。位点信息与表1（图2）相同。
▲图4 STR 短串联重复序列
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* 纯合子：Homozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因相同。即显示单个峰。 * 杂合子：Heterozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因不相同。即显示2个峰。
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▲图6 多等位基因峰图
根据鉴定得到的细胞STR位点信息在ATCC、DSMZ等数据库中进行比对，进入ATCC STR数据库页面（https://www.atcc.org/en/STR_Database.aspx ）输入检测细胞的9个STR位点信息，与ATCC数据库进行对比。
输入信息后给出比对结果（图8）
▲图8 ATCC数据库比对结果
同样在DMSZ数据库进行数据比对，得到匹配结果。
▲图9 DSMZ数据库比对结果
比对结果中"%Match"（ATCC, 图8）及 "EV" （DSMZ, 图9）列是受检细胞的9个STR位点基因分型数据与数据库中细胞的匹配度。
人源细胞STR鉴定结果判定标准：
受检细胞STR位点的基因分型数据与其对应的标准细胞系（其原始组织或衍生细胞系）STR基因分型数据进行比对：
1）若两者的匹配度≥80%，则判定受检细胞系为标准细胞系或为标准细胞系的衍生细胞系。
2）若两者的匹配度在56%-80%之间，建议结合细胞系形态、细胞系特异性标记物等辅助分析进行综合判断。
3）若两者的匹配度≤56%，则判定受检细胞样本与其对应的标准细胞系不相关。
参考文献：
1. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup,A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end. Nat Rev Cancer, 2010. 10(6):p. 441-8.
2. Reid Y, Storts D, Riss T, Minor L. Authentication of Human Cell Lines by STR DNA Profiling Analysis. Assay Guidance Manual [Internet]. Bethesda (MD): Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences; 2004-.2013 May 1. （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK144066/）
