Chirp实验技术
一、Chirp技术概述
ChIRP是研究体内RNA与蛋白互作的有力工具。该技术在特定时间点用甲醛交联等方式固定细胞内RNA与蛋白及核酸的互作复合物，再利用生物素标记的探针及链霉亲和素磁珠纯化出靶RNA及其与它结合的蛋白、核酸复合物，复合物中的蛋白质被洗脱下来做western-blot，可以验证某个蛋白是否与靶RNA结合；洗脱下来的蛋白液做质谱鉴定，即可筛选出与目的RNA结合的蛋白。
二、Chirp技术原理
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用；其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下，与已知的几乎所有生物大分子偶联。
ChIRP技术利用生物素标记探针识别靶RNA，在纯化靶RNA的同时将与它结合的蛋白也一并纯化出来，洗脱得到靶RNA的结合蛋白质。
三、Chirp技术应用-辉骏生物
RNA结合蛋白在体内条件下的验证和筛选。
四、Chirp技术流程-辉骏生物
细胞交联→细胞裂解、超声处理→探针杂交→复合物纯化→蛋白分离→质谱鉴定。
五、辉骏生物服务信息
六、参考文献
1.Genomic maps of long noncoding RNA occupancy reveal principles of RNA-chromatin interactions. Mol Cell 44(4):667-678 (2011).
2.Chromatin isolation by RNA purification (ChIRP).J Vis Exp (61).(2012)
3.Systematic discovery of Xist RNA binding proteins. Cell 161(2):404-416(2015).
详情请联系我们：
企业QQ：4006991663
电话：400-699-1663/020-32053431
邮箱： service@fitgene.com
辉骏生物主页： http://www.fitgene.com
地址：广州市萝岗区科学城广州国际企业孵化器D506
ChIRP是研究体内RNA与蛋白互作的有力工具。该技术在特定时间点用甲醛交联等方式固定细胞内RNA与蛋白及核酸的互作复合物，再利用生物素标记的探针及链霉亲和素磁珠纯化出靶RNA及其与它结合的蛋白、核酸复合物，复合物中的蛋白质被洗脱下来做western-blot，可以验证某个蛋白是否与靶RNA结合；洗脱下来的蛋白液做质谱鉴定，即可筛选出与目的RNA结合的蛋白。
二、Chirp技术原理
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用；其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下，与已知的几乎所有生物大分子偶联。
ChIRP技术利用生物素标记探针识别靶RNA，在纯化靶RNA的同时将与它结合的蛋白也一并纯化出来，洗脱得到靶RNA的结合蛋白质。
三、Chirp技术应用-辉骏生物
RNA结合蛋白在体内条件下的验证和筛选。
四、Chirp技术流程-辉骏生物
细胞交联→细胞裂解、超声处理→探针杂交→复合物纯化→蛋白分离→质谱鉴定。
五、辉骏生物服务信息
| 项目名称 | 客户提供 | 结果交付 |
| CHIRP |
1. 基因信息（物种、序列） 2. 细胞系及培养信息 3. 待验证的蛋白信息 4. 蛋白抗体 |
1. 原始结果图（包括Input、阳性及阴性对照结果） 2. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
| CHIRP-MS |
1. 基因信息（物种、序列或ID） 2. 细胞系及培养信息 |
1. 原始结果图（input和洗脱液的SDS-PAGE图） 2. 质谱检索结果 3. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
六、参考文献
1.Genomic maps of long noncoding RNA occupancy reveal principles of RNA-chromatin interactions. Mol Cell 44(4):667-678 (2011).
2.Chromatin isolation by RNA purification (ChIRP).J Vis Exp (61).(2012)
3.Systematic discovery of Xist RNA binding proteins. Cell 161(2):404-416(2015).
详情请联系我们：
企业QQ：4006991663
电话：400-699-1663/020-32053431
邮箱： service@fitgene.com
辉骏生物主页： http://www.fitgene.com
地址：广州市萝岗区科学城广州国际企业孵化器D506
