罗氏FFPET组织样本抽提RNA试剂盒实验结果分析
浏览次数:6419 发布日期:2015-2-28
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High Pure FFPET RNA Isolation Kit基于离心柱法的抽提原理,在柱上直接进行高效DNase消化,在整合的实验流程中方便地去除残留DNA。 |
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图1:抽提获得宽泛的RNA片段范围,FFPET RNA抽提物片段长度范围在100-4000bp
使用3中不同的方法从乳腺癌组织的5um FFPET样品中抽提总RNA。绿色线显示了使用该方法抽提获得的RNA长片段极少,以RNA降解片段为主。灰色线显示的RNA抽提物覆盖的片段范围较广,但在短片段RNA的分布存在较大的偏倚性。
结果:罗氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit的抽提产物(蓝色线)较均匀地覆盖了整个片段分布范围。 |
 图2:从近期和长期保存的FFPET样品中均可抽提获得高RNA得率 | |
A)柱形图显示了从结肠癌组织和正常结缔组织10um FFPET切片样本中抽提获得的RNA平均得率(n=24)样本保存时间分别为<6个月和>5年。 结果:罗氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit能获得更高得率的RNA抽提产物。 B)显示了图A的最左侧两列柱状图,其24个重复样本各自的RNA得率。24个重复样本来自于组织的连续切片,以避免来自不同组织区域的核酸含量差异。 结果:在常规研究中,同一组织样本的不同FFPET切片的核酸得率存在差异。但对于同一种样本,罗氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit始终能获得更高得率的RNA抽提产物。 |
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图3:从样品中抽提获得高质量的RNA,提高RT-aPCR检测灵敏度。
作为qPCR实验中的核酸模板,要求高质量的RNA,即良好的核酸得率、纯度和片段大小分布,并能高灵敏度和不偏倚地检测模板基因的表达情况。
从3中不同异种移植物切片组织中抽提RNA,取150ng总RNA,使用Transcriptor Universal cDNA Master进行反转录反应,取10ng cDNA产物通过LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument扩增检测ALAST基因表达情况。
结果:High Pure FFPET RNA Isolation Kit抽提获得的RNA模板(n=8)能在RT-qPCR实验中获得更高的检测灵敏度。 | |
产品信息 |
产品 |
目录号 |
包装规格 |
High Pure FFPET RNA Isolation Kit |
06 650 775 001 |
50次抽提反应 | |
阅读原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2015020028.html