多肽序列测定是确定多肽或蛋白质中氨基酸的确切排列顺序的过程。这个过程对于蛋白质功能研究、疾病机制分析、药物设计等领域都至关重要。
一、多肽序列测定技术
1.Edman 降解法:
通过逐步去除多肽N端的氨基酸并测量释放的每一个氨基酸来确定序列,一次测定一个氨基酸,适用于短的多肽序列。
图1
2.质谱测序:
肽质谱测序:通过生成多肽的碎片并测量它们的质量来确定氨基酸的序列。
肽图分析:消化蛋白质产生肽段,然后通过测量肽段的质量并与数据库比对来识别蛋白质。
MS/MS或串联质谱:一种用于获得多肽内部碎片的质量信息的技术,从而推断氨基酸序列。
图2
3.DNA 序列推导:
通过测定编码目标蛋白质的基因的DNA序列,然后通过转录和翻译的信息来推导蛋白质的氨基酸序列。
二、多肽测序应用:
1. 蛋白质鉴定和特性研究
通过多肽序列的确定,研究蛋白质的生物功能、结构和亚型。
2. 抗原多肽设计
利用多肽序列信息,可以设计合成多肽作为实验研究的抗原,用于抗体的生产。
3. 蛋白质工程和药物设计
确定并修改蛋白质或酶的活性位点,优化其功能或特性。
4. 疾病研究和生物标记物的鉴定
分析疾病相关蛋白的多肽序列,用于疾病机制的研究和生物标记物的鉴定。
5. 表达产物验证
在基因克隆、表达蛋白质生产过程中,用于验证目标蛋白质的序列和正确表达。
6. 研究蛋白质间的相互作用
分析蛋白质亚单元之间的交互,探讨蛋白质复合物的组装机制。