PCR Array 常见问题解答

PCR Array FAQ:

1. 任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗？
2. QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。
3. 根据仪器采用的96孔或者384孔板，分为以下5种板型（plate format）：

BioTNT PCR array的适用在哪里？

回答：适用现有的通路研究；

适用少样本或中等样本，多基因的QPCR 检测；

在低样本或中等样本的情况下，费用和时间远小于自行建立QPCR实验；

使用方便，操作简单，结果稳定性好；

BioTNT PCR array的优点是什么？

 Ct值的平均差异只有0.25个循环；

数据分析方便：专用软件方便数据统计与分析

从QPCR 得到实验数据后，如何进行后续的结果分析？需要配套的仪器设备吗？

回答： 您可以用这个链接，http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具，然后再点击：分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

BioTNT 的PCR array，如果自己使用，需要购买哪些配套产品？

http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

PCR array 产品之外，您应购买以下产品，对PCR array进行配套使用：

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒，推荐型号为：

RNase-Free DNase Set (50)，79254 

如果使用其他公司的抽提试剂盒，如Trizol 法抽提试剂盒，能否使用BioTNT的PCR array 产品？

DNA 去除；使用PCR array 产品前，先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本，可以进行PCR array实验。

如何进行PCR array 实验前的样本质量验证？

PCR array实验的质量，建议在使用前先进行样本质量验证；

定量与质量控制

使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本，检测 260  nm 和 280  nm 吸光值，A260/280 应大于 1.8。

使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

建议：RNA 质量测定后，逆转录得到CDNA，建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量；

biotnt 的样本质量验证引物套装，可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物，如human beta actin， GAPDH,  18sRNA等)

基因组DNA污染控制

Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35，则表明存在可检测到的基因组DNA污染，应采取措施予以解决。因此，必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证；验证结果CT 值如果小于35，则表明存在可检测到的基因组DNA污染，应采取措施予以解决。

如何进行样本的调平？

PCR array之前，对样本需要进行调平。具体调平方式为：  

RNA 含量调平：实验样本的RNA 尽量调到同一水平；加入RNA 酶free的水，调整RNA 浓度；

调平后的样本：通过内参引物进行验证，根据CT 值，进行二次调平。

BioTNT PCR array定制费用如何？

BioTNT PCR array 提供您的定制，仅比预制产品增加了400元/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们，然后把您的仪器型号，以及sample 数量，重复数量提供给我们，我们为您设置相应的PCR array 形式，并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制，方式灵活，1 plate起订。

http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx，点击定制服务。

如果我没有QPCR 仪器，BioTNT 能够提供什么服务？

BioTNT PCR array service。

 http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx，点击service。