查找SNP信息的方法介绍

     SNP命名方法有以下几种：

     1、GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法

     GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法是相对比较完善的命名体系，命名方法是rs+7位阿拉伯数字。如果已知一个SNP的refSNP ID，那么就可以在GenBank的SNP数据库中搜索到相关的信息和在基因组中的位置了。譬如我搜索rs776746，你会发现CYP3A5和 RS776746是一个东西。


    
     网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/


     2、突变信息之间加上位置信息：

     又分为三种方式：

     突变信息之间+cDNA的位置，如C188T；

     突变信息之间加上DNA的位置，如A2546G；

     突变氨基酸信息之间加上氨基酸位置，如Glu145Lys.


     3、惯用名或频率顺序拟定的惯用名称：

     在文献中出现的等位基因常见的标注方式，大家最熟悉的如CYP2D6*10、CYP2C9*3等，还有一些前面加个m，表示突变，如CYP2C19m2 等，还有一些也可以在文献中看到，如CYP2E1的C1>C2突变等等，总之形式百花齐放，百家争鸣，让人头晕。其实这就是一种非常不正规的用 HGVS Names标注SNP位置的方法，很明显，由于缺少引用核酸序列的接受号，因此读者无法从这样的表示在GenBank中查到对应的信息。这是个历史遗留问 题，责任也不能全怪原文的作者标注不明。


     4、HGVS命名法：

     HGVS是Human Genome VariationSociety(人类基因组变异协会)的简称，是一个非政府的民间学术组织，其官方网站的网 址：http://www.hgvs.org/。HGVS命名SNP法的规则是标出引用的核酸序列号（Reference Sequence，RefSeq）和SNP在该核酸序列中的位置，例如：NG_000004.3:g.247167G>A，其中红色的部分是核酸序 列接受号，绿色的部分是该单核苷酸多态性位点在该核酸序列中的位置，G>A表示原始碱基是G，突变碱基是A。这样的命名方法有利于找出所在基因序列 中的位置。



     幸福来得太快，但还是完全不知道要从如何查找？您只需要联系我们，我们将免费为您查找相关SNP位点信息。


     记得，绝对无偿提供服务。

     联系我们：邮箱：techsupport@ymbio.com
                       电话：010-62895234