SRM(Selected Reaction Monitoring,选择反应监测)是一种质谱技术,主要用于目标蛋白质或肽段的定量分析。SRM通常使用三重四极杆质谱仪(triple quadrupole mass spectrometer)进行操作,并且是一种高度敏感且特异性强的技术。
以下是SRM靶向蛋白质组学检测的一些基本原理和步骤:
1、目标选择:在实验开始前,首先需要选择希望测量的目标蛋白质或肽段。
2、肽段选择:为了检测蛋白质,通常会选择代表性的肽段(通常被称为“肽图”或“签名肽”)来进行定量。
3、转化为预定的离子:样品在质谱仪中被电离,并且在第一个四极杆中选择预设的前体离子(precursor ion)。
4、碎裂:选定的前体离子在碰撞细胞中与惰性气体碰撞,产生碎片离子。
5、检测特定碎片离子:在第二个四极杆中,特定的碎片离子被选择并检测。这一步提供了SRM的高度特异性。
6、定量:通过测量特定肽段的特定离子的强度,可以定量目标蛋白质在样品中的丰度。
图1. 平行反应监测(PRM)
由于SRM的高度特异性和灵敏度,它已经成为临床研究和生物标志物验证中的一个重要工具。与传统的非靶向质谱蛋白质组学技术相比,SRM提供了更高的定量准确性,尤其是在低丰度蛋白质的情况下。