质谱MRM（多反应监测）与iTRAQ/TMT定量方法分析对比

1.引言

生物药物研究领域中，蛋白质定量是一项重要的任务。准确地测量蛋白质的表达水平对于了解疾病机制、药物研发以及生物标记物的发现具有关键意义。在蛋白质组学研究中，质谱技术是一种常用的方法。本文将重点介绍质谱MRM（多反应监测）与iTRAQ/TMT定量两种常见的蛋白质组学定量方法，并对其进行对比分析。
 

2.质谱MRM定量

质谱MRM是一种基于质谱技术的定量方法，它通过选择特定的肽段和转换反应离子对（transition）来实现对目标蛋白质的定量。首先，通过质谱技术对样品进行分析，获得肽段的质谱谱图。然后，选择特定的肽段和其对应的转换反应离子对进行监测。通过测量这些离子对的峰面积，可以推断出目标蛋白质的含量。

质谱MRM定量方法具有高灵敏度、高选择性和高通量的特点。它可以同时监测多个肽段，从而实现对多个蛋白质的定量。此外，质谱MRM定量方法还可以通过稳定同位素标记技术（如15N标记）来实现绝对定量，提高定量结果的准确性。
 

3.iTRAQ/TMT定量

iTRAQ（同位素标记化反应标记）和TMT（同位素标记化标记）是两种常用的蛋白质组学定量方法。它们通过在样品中引入特定的同位素标记化试剂，将不同样品的蛋白质进行标记，然后将标记的样品混合在一起进行质谱分析。

iTRAQ和TMT定量方法具有高通量、高复现性和高灵敏度的特点。它们可以同时定量多个样品，从而实现高通量的蛋白质组学研究。此外，iTRAQ和TMT定量方法还可以通过选择性地标记特定的氨基酸残基（如精氨酸和赖氨酸）来实现定量的精确性。

4..质谱MRM与iTRAQ/TMT定量的对比

质谱MRM和iTRAQ/TMT定量方法在蛋白质组学研究中都具有重要的应用价值，但它们也存在一些差异。

首先，质谱MRM定量方法具有更高的灵敏度和选择性。它可以选择性地监测目标肽段，从而避免了复杂样品中其他干扰物质的影响。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法需要对整个样品进行质谱分析，可能会受到复杂样品基质的干扰。

其次，质谱MRM定量方法适用于定量少量目标蛋白质的情况。它可以选择性地监测目标肽段，从而实现对少量目标蛋白质的定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法适用于同时定量多个样品的情况，但对于少量目标蛋白质的定量可能不够准确。

最后，质谱MRM定量方法可以实现绝对定量，提高定量结果的准确性。通过稳定同位素标记技术，可以将质谱MRM定量结果与已知浓度的标准品进行比较，从而实现绝对定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法只能实现相对定量，无法得到绝对定量结果。

5.结论

质谱MRM和iTRAQ/TMT定量方法是生物药物研究领域中常用的蛋白质组学定量方法。质谱MRM定量方法具有高灵敏度、高选择性和高通量的特点，适用于定量少量目标蛋白质的情况。iTRAQ/TMT定量方法具有高通量、高复现性和高灵敏度的特点，适用于同时定量多个样品的情况。在选择定量方法时，需要根据实验的具体需求和样品特点进行选择。

图1